Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4E0

5031410I06Rik, RIKEN cDNA 5031410I06 gene, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5031410I06RikE9Q4E0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
5031410I06RikE9Q4E0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
5031410I06RikE9Q4E0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms