Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ54

Gcom1, GRINL1A complex locus, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcom1E9PZ54 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Gcom1E9PZ54 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Gcom1E9PZ54 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms