Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Brd1E9PZ26 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Brd1E9PZ26 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Brd1E9PZ26 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 141.6 ms