Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Gm5415E9PXF3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Gm5415E9PXF3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms