Protein–RNA interactions for Protein: E9PVG0

Gm9008, Predicted pseudogene 9008, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm9008E9PVG0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm9008E9PVG0 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gm9008E9PVG0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms