Protein–RNA interactions for Protein: E9PVD1

Ccdc62, Coiled-coil domain-containing protein 62, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc62E9PVD1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Ccdc62E9PVD1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Ccdc62E9PVD1 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms