Protein–RNA interactions for Protein: E9PV24

Fga, Fibrinogen alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FgaE9PV24 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FgaE9PV24 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
FgaE9PV24 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms