Protein–RNA interactions for Protein: D3Z460

Gm1330, Predicted gene 1330, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm1330D3Z460 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm1330D3Z460 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm1330D3Z460 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms