Protein–RNA interactions for Protein: D3YXS5

Kif28p, Kinesin-like protein KIF28P, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif28pD3YXS5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Kif28pD3YXS5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Kif28pD3YXS5 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms