Protein–RNA interactions for Protein: D3YV89

Mmp27, Matrix metalloproteinase, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp27D3YV89 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp27D3YV89 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Mmp27D3YV89 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Mmp27D3YV89 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp27D3YV89 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp27D3YV89 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp27D3YV89 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp27D3YV89 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp27D3YV89 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp27D3YV89 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp27D3YV89 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp27D3YV89 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp27D3YV89 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp27D3YV89 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp27D3YV89 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp27D3YV89 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp27D3YV89 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp27D3YV89 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp27D3YV89 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Mmp27D3YV89 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms