Protein–RNA interactions for Protein: D3YUM8

Gm4950, Proteasome subunit beta type, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm4950D3YUM8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm4950D3YUM8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm4950D3YUM8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm4950D3YUM8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm4950D3YUM8 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm4950D3YUM8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm4950D3YUM8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm4950D3YUM8 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Gm4950D3YUM8 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm4950D3YUM8 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm4950D3YUM8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm4950D3YUM8 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
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Gm4950D3YUM8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Gm4950D3YUM8 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Gm4950D3YUM8 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm4950D3YUM8 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
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Gm4950D3YUM8 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm4950D3YUM8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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