Protein–RNA interactions for Protein: B2RUQ2

Usf3, Gene model 608, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3B2RUQ2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Usf3B2RUQ2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Usf3B2RUQ2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms