Protein–RNA interactions for Protein: B2RTN3

Zscan5b, Zinc finger and SCAN domain-containing 5B, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zscan5bB2RTN3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Zscan5bB2RTN3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Zscan5bB2RTN3 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms