Protein–RNA interactions for Protein: B2RS91

Rrn3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrn3B2RS91 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rrn3B2RS91 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rrn3B2RS91 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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