Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PtpruB1AUH1 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PtpruB1AUH1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpruB1AUH1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpruB1AUH1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpruB1AUH1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpruB1AUH1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpruB1AUH1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpruB1AUH1 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpruB1AUH1 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpruB1AUH1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpruB1AUH1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpruB1AUH1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpruB1AUH1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpruB1AUH1 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PtpruB1AUH1 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtpruB1AUH1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtpruB1AUH1 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PtpruB1AUH1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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