Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Grik3B1AS29 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Grik3B1AS29 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms