Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Atp8b5A3FIN4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Atp8b5A3FIN4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Atp8b5A3FIN4 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 96.4 ms