Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CatsperbA2RTF1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
CatsperbA2RTF1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms