Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Upf2A2AT37 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Upf2A2AT37 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms