Protein–RNA interactions for Protein: A2ANE1

Rhox3f, Reproductive homeobox 3F, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3fA2ANE1 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Rhox3fA2ANE1 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Rhox3fA2ANE1 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms