Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.18□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
4930447F04RikA2AFR2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms