Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Trbv30A0A0B4J1P1 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms