Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRT9

Gm28490, Predicted gene 28490, mousemouse

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28490A0A087WRT9 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm28490A0A087WRT9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm28490A0A087WRT9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm28490A0A087WRT9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28490A0A087WRT9 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28490A0A087WRT9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28490A0A087WRT9 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28490A0A087WRT9 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gm28490A0A087WRT9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28490A0A087WRT9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28490A0A087WRT9 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28490A0A087WRT9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28490A0A087WRT9 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gm28490A0A087WRT9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gm28490A0A087WRT9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Gm28490A0A087WRT9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gm28490A0A087WRT9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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