Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gm29484-201ENSMUST00000186067 324 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 1700016P04Rik-201ENSMUST00000186770 429 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm28482-201ENSMUST00000189350 452 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm37135-201ENSMUST00000192652 534 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm33093-201ENSMUST00000197751 790 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm42951-201ENSMUST00000199688 684 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm4714-201ENSMUST00000203395 279 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm44997-202ENSMUST00000205970 425 ntTSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm44820-201ENSMUST00000207420 396 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 AC183268.2-201ENSMUST00000214513 446 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 AC115034.1-201ENSMUST00000215393 3846 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 AC132384.3-201ENSMUST00000219709 472 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 AC156632.1-201ENSMUST00000220626 3845 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 AC165347.1-201ENSMUST00000224089 1025 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 CT025548.1-201ENSMUST00000227459 257 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 AC166105.1-201ENSMUST00000227512 482 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 AC106830.1-201ENSMUST00000228032 1003 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 CT009515.1-201ENSMUST00000228127 586 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 AC127371.1-201ENSMUST00000228516 312 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 AC154239.1-201ENSMUST00000228565 406 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Ssmem1-202ENSMUST00000031798 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Cd84-201ENSMUST00000042302 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Tas2r119-201ENSMUST00000057633 1006 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Fam183b-202ENSMUST00000094156 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Xirp2-201ENSMUST00000028410 11955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4a31-201ENSMUST00000030480 2396 ntTSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm37562-201ENSMUST00000194763 4328 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Lrrtm4-202ENSMUST00000126005 3733 ntTSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Olfr699-203ENSMUST00000216307 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm29398-201ENSMUST00000186355 1491 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw27-208ENSMUST00000212725 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 AC154627.2-201ENSMUST00000227028 4669 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Stag2-202ENSMUST00000115072 5955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Hdx-202ENSMUST00000113422 9534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Nxf3-201ENSMUST00000080929 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Olfr291-202ENSMUST00000217039 3471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Fap-201ENSMUST00000000402 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm38451-201ENSMUST00000208329 2646 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Olfr715b-202ENSMUST00000215713 3879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Pramel5-201ENSMUST00000035757 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm26522-201ENSMUST00000181565 1555 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 C730045M19Rik-201ENSMUST00000201944 1315 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Nfia-204ENSMUST00000107057 8913 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Prrc2c-210ENSMUST00000182660 11502 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm38335-201ENSMUST00000195727 1789 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Aadacl3-201ENSMUST00000105749 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r3-201ENSMUST00000170244 2670 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-84-201ENSMUST00000103551 351 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm14711-201ENSMUST00000117056 217 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm11774-201ENSMUST00000118601 293 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm14516-201ENSMUST00000120012 252 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm6031-201ENSMUST00000121314 1054 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm6977-201ENSMUST00000121568 512 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Rps29-ps-201ENSMUST00000122083 172 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm22958-201ENSMUST00000122512 184 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 1700021L23Rik-201ENSMUST00000153719 726 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm14246-201ENSMUST00000155173 680 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm22804-201ENSMUST00000158052 101 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm24675-201ENSMUST00000158757 259 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm22993-201ENSMUST00000175423 254 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm26954-201ENSMUST00000182106 622 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Mir6908-201ENSMUST00000184056 63 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Ccl12-201ENSMUST00000000194 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 4930563F08Rik-201ENSMUST00000198640 515 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 1700093K21Rik-201ENSMUST00000020527 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm44730-201ENSMUST00000205902 716 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Letm2-206ENSMUST00000210234 837 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 CT033754.1-201ENSMUST00000216941 531 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
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Sft2d1Q5SSN7 AC137902.1-201ENSMUST00000228184 102 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 4931400O07Rik-201ENSMUST00000033537 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Efna5-202ENSMUST00000078839 643 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm24036-201ENSMUST00000082868 156 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Olfr110-202ENSMUST00000216472 1721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm8980-201ENSMUST00000140232 2197 ntBASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Olfr657-202ENSMUST00000213297 1948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Nxf2-201ENSMUST00000010085 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Rgs21-202ENSMUST00000184189 1674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm33336-201ENSMUST00000219656 1676 ntTSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Kcnh8-201ENSMUST00000039366 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1459-202ENSMUST00000213493 8854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.28□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r84-204ENSMUST00000227427 2880 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.28□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Trim12c-201ENSMUST00000059037 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.28□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm14976-201ENSMUST00000117055 1394 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Olfr559-202ENSMUST00000215657 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.27□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Gm37010-201ENSMUST00000194539 1704 ntBASIC4.27□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Zfp329-201ENSMUST00000072222 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
Sft2d1Q5SSN7 Pou2f1-208ENSMUST00000160260 13022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.27□□□□□ -1.73
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