Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm28554-201ENSMUST00000187964 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm28984-201ENSMUST00000188202 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm28295-201ENSMUST00000188322 622 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm21529-202ENSMUST00000188473 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm28604-202ENSMUST00000188638 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm21588-202ENSMUST00000188721 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm21539-202ENSMUST00000188764 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm28216-201ENSMUST00000188785 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm29578-201ENSMUST00000188809 537 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm29645-201ENSMUST00000189117 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm28554-202ENSMUST00000189175 484 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm21413-201ENSMUST00000189224 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm21723-202ENSMUST00000189444 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm36782-201ENSMUST00000189459 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm21419-201ENSMUST00000189495 173 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm28566-202ENSMUST00000189532 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm29166-202ENSMUST00000189600 537 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm29213-202ENSMUST00000189703 484 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm21626-202ENSMUST00000189751 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm28765-201ENSMUST00000189752 537 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm28851-202ENSMUST00000189757 484 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm28656-201ENSMUST00000190017 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm28461-201ENSMUST00000190023 484 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm28617-202ENSMUST00000190129 537 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm21562-202ENSMUST00000190314 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm28517-201ENSMUST00000190343 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm28522-202ENSMUST00000190561 537 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm29531-201ENSMUST00000190569 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm21914-202ENSMUST00000190577 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm20978-201ENSMUST00000190688 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm28834-202ENSMUST00000190714 537 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm20963-201ENSMUST00000190880 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm29316-201ENSMUST00000190953 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm29351-201ENSMUST00000191052 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm28987-201ENSMUST00000191071 537 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm29466-201ENSMUST00000191077 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm20987-201ENSMUST00000191165 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm28194-202ENSMUST00000191217 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm28461-202ENSMUST00000191406 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm29132-202ENSMUST00000191588 622 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm30174-201ENSMUST00000191682 537 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm36261-201ENSMUST00000191807 537 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm37927-201ENSMUST00000192238 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm37544-201ENSMUST00000192803 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm37635-201ENSMUST00000193129 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm21809-202ENSMUST00000194072 174 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm34550-202ENSMUST00000195186 537 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm37445-201ENSMUST00000195318 242 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm43554-201ENSMUST00000199987 186 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Nxpe1-ps-203ENSMUST00000210879 822 ntTSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 AC107757.1-201ENSMUST00000226780 357 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Mir129-1-201ENSMUST00000083535 73 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm26163-201ENSMUST00000083792 178 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r2-202ENSMUST00000177151 2727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm42998-201ENSMUST00000197053 2371 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Gm42860-201ENSMUST00000196492 3991 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Cyp3a16-201ENSMUST00000031633 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Olfr109-202ENSMUST00000214668 5861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 A230103L15Rik-201ENSMUST00000207198 3872 ntBASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Mmp13-201ENSMUST00000015394 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.22□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Zfp229-203ENSMUST00000182603 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Nusap1-202ENSMUST00000068225 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Obox3-202ENSMUST00000095217 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.41
Traf3ip1Q149C2 AC158981.2-201ENSMUST00000227565 1537 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Zfp951-202ENSMUST00000186219 2904 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Olfr329-ps-203ENSMUST00000219448 4052 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm6558-201ENSMUST00000191934 1973 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Naip2-203ENSMUST00000167986 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm15803-201ENSMUST00000120118 394 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm15786-201ENSMUST00000121079 450 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Atxn3-204ENSMUST00000160251 998 ntTSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Trav6-5-202ENSMUST00000183488 335 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm27541-201ENSMUST00000184078 122 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm28467-201ENSMUST00000190981 318 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm37215-201ENSMUST00000194927 1259 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 AC155808.1-201ENSMUST00000219288 409 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 AC162467.1-201ENSMUST00000220254 621 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 AC166574.3-201ENSMUST00000226725 367 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r200-205ENSMUST00000228726 5525 ntAPPRIS P2 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Lyrm1-201ENSMUST00000054440 752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Orm3-201ENSMUST00000006687 773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Olfr371-201ENSMUST00000070849 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Gm23508-201ENSMUST00000083079 72 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Mir449a-201ENSMUST00000083641 91 ntBASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Senp8-202ENSMUST00000163586 3570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Traf3ip1Q149C2 Slc9a9-201ENSMUST00000033463 3468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.21□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.1 ms