Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Fam135a-208ENSMUST00000187752 5194 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VdrP48281 Nxpe2-201ENSMUST00000034527 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VdrP48281 1700024B05Rik-202ENSMUST00000168972 1573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VdrP48281 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC6.91□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm8267-203ENSMUST00000226900 1592 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC152946.1-201ENSMUST00000218446 3474 ntTSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.3
VdrP48281 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 5530601H04Rik-207ENSMUST00000138460 3732 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Bcas3os1-202ENSMUST00000151652 3138 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm6614-203ENSMUST00000181791 2450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Acsm2-207ENSMUST00000167935 6738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm10555-201ENSMUST00000193178 1791 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Platr25-201ENSMUST00000143260 2509 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Vmn2r77-201ENSMUST00000164996 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Olfr75-ps1-203ENSMUST00000144832 2655 ntTSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Depdc1a-202ENSMUST00000106041 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Trappc8-201ENSMUST00000025177 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Cx3cr1-203ENSMUST00000215016 4493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Trbv1-201ENSMUST00000103262 417 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm23424-201ENSMUST00000103889 110 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm22771-201ENSMUST00000104449 91 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Cd209d-201ENSMUST00000011445 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Vgll1-202ENSMUST00000114745 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm14248-201ENSMUST00000117790 544 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm15739-201ENSMUST00000118049 872 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm12944-201ENSMUST00000119262 463 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm15153-201ENSMUST00000119867 274 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm11410-201ENSMUST00000120053 1143 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm14925-201ENSMUST00000120611 438 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Amy2-ps1-201ENSMUST00000122117 1117 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 4933406K04Rik-202ENSMUST00000124363 1064 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Xaf1-202ENSMUST00000140842 651 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Plxna4os3-202ENSMUST00000143328 277 ntTSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm25387-201ENSMUST00000157813 132 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm25348-201ENSMUST00000158961 111 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm17217-201ENSMUST00000166613 469 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Trbv10-201ENSMUST00000168322 289 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm17177-201ENSMUST00000169144 483 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Faiml-201ENSMUST00000178051 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm26925-201ENSMUST00000182470 957 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm11983-202ENSMUST00000184940 318 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 1700120K04Rik-201ENSMUST00000191038 546 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm8101-201ENSMUST00000192796 478 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm37152-201ENSMUST00000193369 1175 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 A930005N03Rik-201ENSMUST00000194920 1247 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm8924-201ENSMUST00000197405 1132 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm45686-202ENSMUST00000211580 1138 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC164576.1-201ENSMUST00000218783 693 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 4930543I11Rik-201ENSMUST00000219006 959 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC155834.1-201ENSMUST00000220033 498 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm18503-201ENSMUST00000220340 728 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC124732.4-201ENSMUST00000220930 1274 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC164295.1-201ENSMUST00000224861 186 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC187103.4-201ENSMUST00000225399 300 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm8256-203ENSMUST00000228692 591 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm5528-201ENSMUST00000076314 480 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Olfr99-201ENSMUST00000077585 918 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm24928-201ENSMUST00000083399 107 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Gm25897-201ENSMUST00000083709 107 ntBASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Olfr1220-201ENSMUST00000099789 1026 ntAPPRIS P1 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Olfr1220-202ENSMUST00000099806 1201 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Evi2-202ENSMUST00000170422 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Olfr187-202ENSMUST00000207673 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.3
VdrP48281 Zgrf1-201ENSMUST00000043108 7046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
VdrP48281 Gm14635-202ENSMUST00000146535 1409 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
VdrP48281 Kcnmb2-205ENSMUST00000192429 2357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
VdrP48281 Gm13974-201ENSMUST00000144368 1454 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
VdrP48281 Slf1-201ENSMUST00000151524 3747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.9□□□□□ -1.31
VdrP48281 4930548H24Rik-201ENSMUST00000031020 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
VdrP48281 9330159M07Rik-201ENSMUST00000180712 2702 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
VdrP48281 Spata31d1d-201ENSMUST00000052978 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.9□□□□□ -1.31
VdrP48281 Msantd4-202ENSMUST00000212075 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
VdrP48281 Gm38699-201ENSMUST00000221301 1740 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
VdrP48281 Mir99ahg-201ENSMUST00000068704 2858 ntTSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
VdrP48281 Gm36927-201ENSMUST00000192504 1841 ntBASIC6.9□□□□□ -1.31
VdrP48281 Ttc33-201ENSMUST00000022751 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.9□□□□□ -1.31
VdrP48281 Acpp-201ENSMUST00000062723 4483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
VdrP48281 AC174459.1-201ENSMUST00000224476 1943 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
VdrP48281 Otogl-201ENSMUST00000165341 8763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
VdrP48281 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
VdrP48281 Dcdc5-202ENSMUST00000122388 4957 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
VdrP48281 Prox1-202ENSMUST00000175916 7913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
VdrP48281 Zfp184-201ENSMUST00000006903 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
VdrP48281 Gm44677-201ENSMUST00000209151 3739 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
VdrP48281 Aftph-205ENSMUST00000146722 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
VdrP48281 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
VdrP48281 Serpinb5-202ENSMUST00000112729 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
VdrP48281 Plb1-201ENSMUST00000101376 4699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
VdrP48281 Olfr685-202ENSMUST00000209409 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
VdrP48281 Phospho2-206ENSMUST00000180290 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
VdrP48281 Ccdc146-202ENSMUST00000115245 3389 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.89□□□□□ -1.31
VdrP48281 Gm4073-201ENSMUST00000176792 3500 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
VdrP48281 Slfn14-201ENSMUST00000163961 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
VdrP48281 Gm614-201ENSMUST00000101358 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.89□□□□□ -1.31
VdrP48281 Mir503-201ENSMUST00000102168 71 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
VdrP48281 Mir760-201ENSMUST00000103257 119 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
VdrP48281 Olfr997-ps1-201ENSMUST00000117353 939 ntBASIC6.89□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms