Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm5383-201ENSMUST00000121177 617 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 n-R5s98-201ENSMUST00000122549 119 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Hmgb4os-201ENSMUST00000131581 518 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm11802-201ENSMUST00000137749 653 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Tcrg-C4-201ENSMUST00000179181 985 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm28567-201ENSMUST00000190270 693 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm19002-201ENSMUST00000192649 1012 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm8325-202ENSMUST00000193411 182 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm37044-201ENSMUST00000193531 693 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm38369-201ENSMUST00000195101 693 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm42452-201ENSMUST00000199749 617 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm44422-201ENSMUST00000204142 1025 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm45700-201ENSMUST00000205866 347 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 E230029C05Rik-206ENSMUST00000208547 814 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm46223-201ENSMUST00000215196 675 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 AC113082.2-201ENSMUST00000215876 756 ntTSL 3 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 4933412O06Rik-201ENSMUST00000222681 1123 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 AC120375.2-202ENSMUST00000228722 397 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Olfr714-201ENSMUST00000054629 954 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm10061-201ENSMUST00000073111 465 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Olfr739-201ENSMUST00000075261 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm10108-201ENSMUST00000078246 319 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 R3hdm1-201ENSMUST00000036288 4795 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm42535-201ENSMUST00000197312 1399 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Lpp-202ENSMUST00000078988 15440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 B230303O12Rik-201ENSMUST00000199119 3645 ntTSL 1 (best) BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Mga-201ENSMUST00000046717 11982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm16185-201ENSMUST00000125071 3207 ntTSL 5 BASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC4.61□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Olfr984-202ENSMUST00000213858 5186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Olfr1406-202ENSMUST00000201132 2952 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Olfr684-203ENSMUST00000215744 3084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm43887-201ENSMUST00000204727 3186 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm19131-202ENSMUST00000203464 3208 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 CT030159.1-201ENSMUST00000221580 2261 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm3636-201ENSMUST00000100904 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Trbv12-2-201ENSMUST00000103269 385 ntAPPRIS P1 BASIC4.6□□□□□ -1.67
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Ccl20O89093 Gm3173-201ENSMUST00000112776 519 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 1110059G10Rik-202ENSMUST00000118422 723 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm11761-201ENSMUST00000121392 445 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 n-R5s21-201ENSMUST00000122692 117 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm14216-202ENSMUST00000155334 492 ntTSL 2 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm3173-202ENSMUST00000164603 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm3264-201ENSMUST00000166410 519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm8108-201ENSMUST00000167397 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Nup205-202ENSMUST00000170234 1120 ntTSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm3005-201ENSMUST00000178060 444 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm3488-201ENSMUST00000178220 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm3317-201ENSMUST00000179659 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm37609-201ENSMUST00000191778 678 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm18717-201ENSMUST00000192744 1241 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
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Ccl20O89093 Gm3970-201ENSMUST00000198001 334 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm31305-202ENSMUST00000200435 761 ntTSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
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Ccl20O89093 Smr3a-201ENSMUST00000031211 635 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 9430007A20Rik-201ENSMUST00000030328 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm45222-201ENSMUST00000207029 4307 ntBASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Olfr114-203ENSMUST00000216249 1457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 BC030870-201ENSMUST00000098713 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Olfr843-203ENSMUST00000214267 7071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.6□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Zfp369-202ENSMUST00000126879 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Zfp78-206ENSMUST00000208390 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Rprd2-202ENSMUST00000197449 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm26078-201ENSMUST00000104067 128 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm23593-201ENSMUST00000104309 120 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm22372-201ENSMUST00000104589 136 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Rps15a-201ENSMUST00000106588 640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Glrb-202ENSMUST00000107743 1101 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Orc3-202ENSMUST00000108142 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Zbtb8os-202ENSMUST00000119480 527 ntTSL 5 BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm23211-201ENSMUST00000122717 308 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm15600-201ENSMUST00000153522 856 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm15892-203ENSMUST00000156149 1001 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 4933404K08Rik-201ENSMUST00000156977 1434 ntTSL 1 (best) BASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm25430-201ENSMUST00000157614 289 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm23224-201ENSMUST00000158122 271 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm3216-201ENSMUST00000166927 486 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm8323-201ENSMUST00000168436 1201 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm3141-201ENSMUST00000168726 499 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm2877-201ENSMUST00000178248 1204 ntBASIC4.59□□□□□ -1.67
Ccl20O89093 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC4.59□□□□□ -1.67
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