Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Ighv1-66-201ENSMUST00000103537 399 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Traj2-201ENSMUST00000103738 66 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm11256-201ENSMUST00000118109 829 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm12262-201ENSMUST00000119915 305 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm7973-201ENSMUST00000122107 488 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm12602-202ENSMUST00000154352 707 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm25904-201ENSMUST00000158491 143 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r-ps72-201ENSMUST00000172586 907 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm4134-201ENSMUST00000173244 563 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm20519-201ENSMUST00000173684 359 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Plac1-203ENSMUST00000174390 907 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm10251-201ENSMUST00000178788 384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm26557-201ENSMUST00000180756 493 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm20619-205ENSMUST00000181633 581 ntTSL 2 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm26959-201ENSMUST00000182376 978 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm28209-201ENSMUST00000187956 775 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm28075-201ENSMUST00000189179 354 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm36793-201ENSMUST00000199211 922 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm34333-201ENSMUST00000200363 669 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm43786-201ENSMUST00000201722 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm42961-201ENSMUST00000202023 181 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm20136-201ENSMUST00000207501 891 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm44733-201ENSMUST00000208067 543 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 A930002H02Rik-201ENSMUST00000208672 1178 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm19092-201ENSMUST00000209036 969 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm45724-201ENSMUST00000213031 420 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 AC160138.1-201ENSMUST00000217965 588 ntTSL 3 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm34552-201ENSMUST00000223381 636 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 AC154795.1-201ENSMUST00000225611 364 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 AC154634.2-201ENSMUST00000225983 1184 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Cxcl13-201ENSMUST00000023840 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Rpl38-201ENSMUST00000077915 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 n-R5s161-201ENSMUST00000083728 114 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm23502-201ENSMUST00000083902 145 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm12888-201ENSMUST00000097905 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Ulbp1-203ENSMUST00000218087 5959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Zfp935-201ENSMUST00000076195 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm37607-201ENSMUST00000194925 2623 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Usf3-204ENSMUST00000169582 12604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm37589-201ENSMUST00000193609 3994 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm26835-201ENSMUST00000181888 3274 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1057-202ENSMUST00000217435 3249 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm42923-201ENSMUST00000198438 2896 ntBASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm30302-202ENSMUST00000220773 3511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm28278-201ENSMUST00000185603 1499 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm28279-201ENSMUST00000186248 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm28491-202ENSMUST00000186902 1493 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm29368-201ENSMUST00000187201 1489 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm28088-202ENSMUST00000187402 1493 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm28674-201ENSMUST00000187502 1493 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm28131-203ENSMUST00000187841 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm28487-202ENSMUST00000187894 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm29056-201ENSMUST00000187933 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm29074-203ENSMUST00000188026 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm28999-201ENSMUST00000188063 1498 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm28754-201ENSMUST00000188778 1493 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm28520-202ENSMUST00000189379 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm29275-202ENSMUST00000189475 1494 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm28963-202ENSMUST00000189567 1493 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm28519-203ENSMUST00000190126 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm29207-202ENSMUST00000190931 1493 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm28310-202ENSMUST00000191136 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm29646-202ENSMUST00000191146 1493 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm28762-203ENSMUST00000191259 1493 ntTSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm28393-201ENSMUST00000191261 1498 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm28691-202ENSMUST00000191561 1493 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm38168-201ENSMUST00000191717 1493 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm38174-201ENSMUST00000191787 1494 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm37572-202ENSMUST00000194043 1493 ntTSL 5 BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Scel-201ENSMUST00000095576 2424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.3□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm37696-201ENSMUST00000194223 3349 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Zfp780b-204ENSMUST00000206685 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Apob-202ENSMUST00000037811 13934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Npat-201ENSMUST00000035850 6062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 B020004J07Rik-201ENSMUST00000084386 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm33680-202ENSMUST00000219411 3401 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 CT025710.1-201ENSMUST00000222949 2533 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Cyp4a31-202ENSMUST00000030486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Clvs1-201ENSMUST00000038841 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Igkv10-95-201ENSMUST00000103329 287 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1330-202ENSMUST00000105035 1027 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Olfr50-201ENSMUST00000112950 1157 ntAPPRIS P1 BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm14744-201ENSMUST00000114039 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm15741-201ENSMUST00000119401 754 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl24-203ENSMUST00000121048 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm23883-201ENSMUST00000122686 290 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm12249-201ENSMUST00000132323 719 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 4930556I23Rik-201ENSMUST00000160659 560 ntTSL 1 (best) BASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm7952-201ENSMUST00000180540 984 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
Sft2d1Q5SSN7 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC4.29□□□□□ -1.72
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