Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Olfr1147-ps1-201ENSMUST00000122179 913 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 4930434B07Rik-201ENSMUST00000190254 1020 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Csn2-209ENSMUST00000199624 890 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm19880-201ENSMUST00000207731 318 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 4930591E09Rik-201ENSMUST00000215643 480 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm36372-201ENSMUST00000221011 778 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 AC211878.2-201ENSMUST00000222486 488 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Enkur-201ENSMUST00000027992 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 C130073F10Rik-201ENSMUST00000051043 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr866-201ENSMUST00000062248 1077 ntAPPRIS P1 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Csn2-201ENSMUST00000082370 1117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Snord15b-201ENSMUST00000083032 145 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Ugt1a7c-202ENSMUST00000113135 3302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Vmn1r81-202ENSMUST00000227080 13256 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm43302-201ENSMUST00000050011 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr1449-203ENSMUST00000214079 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm42702-201ENSMUST00000199515 4217 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr60-205ENSMUST00000216027 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Hmgn2l6-201ENSMUST00000115986 267 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm14756-201ENSMUST00000116395 240 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm23879-201ENSMUST00000116874 126 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm11925-201ENSMUST00000121375 535 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm15691-201ENSMUST00000138626 849 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm16035-201ENSMUST00000153879 401 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm26069-201ENSMUST00000157497 277 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm3159-201ENSMUST00000164038 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 2310031A07Rik-201ENSMUST00000181212 990 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm4221-201ENSMUST00000181538 1232 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm19029-201ENSMUST00000189923 564 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm37421-201ENSMUST00000193088 132 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm33050-201ENSMUST00000198132 501 ntTSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm30928-202ENSMUST00000206881 271 ntTSL 3 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr1310-201ENSMUST00000207169 1009 ntAPPRIS P1 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm33756-201ENSMUST00000211358 636 ntTSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Supt4b-201ENSMUST00000214434 351 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Nme5-201ENSMUST00000079287 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm22807-201ENSMUST00000082737 129 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Mir342-201ENSMUST00000083502 99 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm94-201ENSMUST00000096570 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Vmn1r37-204ENSMUST00000226974 1770 ntAPPRIS P2 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr701-203ENSMUST00000217739 4100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Zfp81-201ENSMUST00000054072 6639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr1377-202ENSMUST00000213291 2441 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm38096-201ENSMUST00000193692 2389 ntBASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr1239-203ENSMUST00000217181 1516 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Hspa13-201ENSMUST00000046283 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.3□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr308-202ENSMUST00000214977 4991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm38372-201ENSMUST00000194854 4028 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Vmn1r31-205ENSMUST00000228586 2115 ntAPPRIS P2 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Ehf-203ENSMUST00000111176 3696 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm26814-201ENSMUST00000181178 4149 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Zp3r-202ENSMUST00000128128 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Acad11-202ENSMUST00000120854 3108 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm24628-201ENSMUST00000122761 289 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Crem-224ENSMUST00000147138 436 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Mir1946b-201ENSMUST00000157853 133 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Hoxd10P28359 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
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Hoxd10P28359 Trav7d-5-201ENSMUST00000197128 340 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
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Hoxd10P28359 Gm45305-201ENSMUST00000209799 815 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm45731-201ENSMUST00000211988 1203 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gtpbp4-204ENSMUST00000222098 8783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Mdga2-211ENSMUST00000222623 1449 ntTSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr424-201ENSMUST00000053941 948 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm23626-201ENSMUST00000082458 133 ntBASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Rab3b-202ENSMUST00000106650 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 4921539E11Rik-201ENSMUST00000030245 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Ulbp1-202ENSMUST00000177585 3815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Nav3-201ENSMUST00000032719 9962 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Itih4-204ENSMUST00000168782 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.29□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Prrg1-210ENSMUST00000177904 3851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Lhfpl3-201ENSMUST00000196406 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm10030-203ENSMUST00000197321 3824 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Rnd3-203ENSMUST00000154545 2967 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Cenpf-204ENSMUST00000171929 11130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 B130034C11Rik-201ENSMUST00000175717 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Fat1-205ENSMUST00000191428 14814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.28□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Rpl7a-ps9-201ENSMUST00000117118 777 ntBASIC6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms