Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Hmgn3-205ENSMUST00000187193 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm37710-201ENSMUST00000193501 1274 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 1700019C18Rik-202ENSMUST00000221688 1047 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Cpeb4-202ENSMUST00000109412 6303 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Capn13-201ENSMUST00000095208 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Clasp1-204ENSMUST00000178710 7566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Cux1-201ENSMUST00000004097 12862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
NischQ80TM9 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Fam205c-201ENSMUST00000055944 1655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Olfr1038-ps-202ENSMUST00000216665 4530 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 CT025556.1-201ENSMUST00000222965 1884 ntBASIC11.21□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Cyp2c65-201ENSMUST00000087236 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Trav2-201ENSMUST00000103568 325 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm13452-201ENSMUST00000120896 1097 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm15589-201ENSMUST00000144193 271 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm21909-201ENSMUST00000178260 439 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Vmn2r-ps23-201ENSMUST00000178719 571 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 CR974592.1-201ENSMUST00000220422 574 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Olfr1392-205ENSMUST00000214598 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm43154-208ENSMUST00000209658 1442 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm39465-201ENSMUST00000213810 9813 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm38062-201ENSMUST00000192541 1856 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Olfr644-202ENSMUST00000213184 3572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm16189-201ENSMUST00000123707 997 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 1700123O12Rik-204ENSMUST00000146783 577 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm5699-201ENSMUST00000152491 723 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm28097-201ENSMUST00000187333 366 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 D030025E07Rik-204ENSMUST00000198275 653 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm42459-201ENSMUST00000199679 742 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm6051-201ENSMUST00000201529 352 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 AC164624.1-201ENSMUST00000219148 1025 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm19035-201ENSMUST00000193299 1742 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Cdc27-201ENSMUST00000093923 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Grin2a-206ENSMUST00000199708 14634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Olfr1272-202ENSMUST00000117141 2442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm8878-201ENSMUST00000173552 1725 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Mup-ps18-201ENSMUST00000120145 531 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Astx4d-201ENSMUST00000123136 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Astx3-201ENSMUST00000123508 1150 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Astx4a-201ENSMUST00000177683 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Astx4c-201ENSMUST00000178390 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Astx4b-201ENSMUST00000179359 1149 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 4930509E16Rik-201ENSMUST00000181405 1191 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm4321-201ENSMUST00000200520 442 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Rpl21-ps6-201ENSMUST00000074828 468 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Hist1h2bb-201ENSMUST00000099703 508 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Vmn1r204-202ENSMUST00000228195 2936 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Vamp4-207ENSMUST00000155003 1428 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm37855-201ENSMUST00000192571 3700 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Mrgprb1-201ENSMUST00000094384 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm7529-201ENSMUST00000213753 1897 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Cyp2j14-ps-201ENSMUST00000117776 361 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm12190-201ENSMUST00000120001 187 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm17014-201ENSMUST00000120765 168 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Rpl9-ps5-201ENSMUST00000174221 571 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Mir6975-201ENSMUST00000184879 61 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Olfr1391-201ENSMUST00000187509 938 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm28962-201ENSMUST00000187993 621 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC11.18□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm29048-202ENSMUST00000190399 1601 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Luzp1-201ENSMUST00000001116 7246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Rad21l-201ENSMUST00000096439 1650 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Hecw1-201ENSMUST00000110516 9460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Lrguk-204ENSMUST00000228187 10475 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Muc6-203ENSMUST00000190907 8757 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Coro2a-203ENSMUST00000107757 4124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Mllt3-207ENSMUST00000148059 422 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm26554-201ENSMUST00000180801 845 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm28503-201ENSMUST00000185966 147 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm5288-201ENSMUST00000198323 1119 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm42567-201ENSMUST00000199268 352 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 AC153955.3-201ENSMUST00000216787 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Aoah-202ENSMUST00000221982 919 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm44175-201ENSMUST00000204863 4256 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm32592-201ENSMUST00000205146 3124 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Rab11fip2-203ENSMUST00000171986 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 AC130827.1-201ENSMUST00000220476 3850 ntBASIC11.17□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Zfp619-201ENSMUST00000108015 5969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Mir6412-201ENSMUST00000184477 97 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm32846-201ENSMUST00000205665 842 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Gm17999-201ENSMUST00000211568 542 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 AC166258.1-201ENSMUST00000219823 893 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 Olfr116-201ENSMUST00000072265 966 ntAPPRIS P1 BASIC11.16□□□□□ -0.62
NischQ80TM9 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
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