Protein–RNA interactions for Protein: Q1RNF8

Samd11, Sterile alpha motif domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd11Q1RNF8 Gm18191-201ENSMUST00000174624 824 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 1700010L04Rik-203ENSMUST00000179662 1015 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Mir6952-201ENSMUST00000185092 61 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm29534-201ENSMUST00000187328 382 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm7142-201ENSMUST00000194232 586 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm43096-201ENSMUST00000196173 421 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Igkv12-66-201ENSMUST00000199305 348 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm4742-201ENSMUST00000200261 771 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm44795-201ENSMUST00000205496 319 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm41231-201ENSMUST00000211525 449 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm20474-202ENSMUST00000220772 462 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Mlh3-203ENSMUST00000220854 4699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 AC122327.2-201ENSMUST00000220883 120 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm18592-201ENSMUST00000221529 276 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 AC122327.3-201ENSMUST00000221852 120 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 AC166341.1-201ENSMUST00000223360 105 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Prss58-201ENSMUST00000063523 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Ifitm6-201ENSMUST00000081924 663 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Mup13-202ENSMUST00000098042 984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Olfr552-201ENSMUST00000098223 954 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Olfr1162-201ENSMUST00000099837 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gria3-202ENSMUST00000115103 3081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm37936-201ENSMUST00000194647 1322 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Zfp473-204ENSMUST00000120798 3559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Ank3-230ENSMUST00000182795 3557 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm38036-201ENSMUST00000194586 3564 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Tpp1-201ENSMUST00000033184 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Rgs22-203ENSMUST00000172831 4006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Dopey1-218ENSMUST00000190957 9187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm37786-201ENSMUST00000191714 3225 ntBASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Myh8-202ENSMUST00000108685 2306 ntTSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Celf2-202ENSMUST00000100429 7491 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Plch1-206ENSMUST00000159676 6560 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Sytl2-207ENSMUST00000190837 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Olfr1330-203ENSMUST00000106361 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm11346-204ENSMUST00000149751 2893 ntTSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Olfr1351-202ENSMUST00000216030 2489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Cd44-207ENSMUST00000111194 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 C87436-201ENSMUST00000050497 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Ranbp6-201ENSMUST00000099525 4575 ntAPPRIS P1 BASIC7.17□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Xpnpep3-203ENSMUST00000163754 5383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm6494-201ENSMUST00000218604 2298 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm43113-201ENSMUST00000199713 1754 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm15001-201ENSMUST00000117657 795 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm9498-201ENSMUST00000140849 291 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 AI662270-203ENSMUST00000145461 592 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Mir5107-201ENSMUST00000175586 88 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Mir3090-201ENSMUST00000175597 87 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm26092-201ENSMUST00000179798 97 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm23379-201ENSMUST00000180026 107 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Mir669a-1-201ENSMUST00000180238 97 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm27242-201ENSMUST00000184211 1151 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Sult2a6-202ENSMUST00000184731 664 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm28564-201ENSMUST00000190864 240 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Tmem167-ps1-201ENSMUST00000191236 214 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm37610-201ENSMUST00000191867 620 ntTSL 3 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm6631-201ENSMUST00000193699 559 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm31925-202ENSMUST00000194266 537 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm42564-201ENSMUST00000196013 582 ntTSL 5 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 AC157822.1-201ENSMUST00000196643 80 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm5110-201ENSMUST00000203122 1063 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm45673-201ENSMUST00000210293 358 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
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Samd11Q1RNF8 AC133650.1-201ENSMUST00000217243 578 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Mrpl42-203ENSMUST00000218893 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 CT485612.3-201ENSMUST00000222179 408 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 CT030662.2-201ENSMUST00000226942 805 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 AC119573.1-201ENSMUST00000227960 757 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Olfr399-201ENSMUST00000059440 1003 ntAPPRIS P1 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm2531-201ENSMUST00000075609 512 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm15732-201ENSMUST00000079794 480 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 4930524N10Rik-201ENSMUST00000082357 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Olfr1134-201ENSMUST00000099857 1102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Hmgn5-201ENSMUST00000033597 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm44215-201ENSMUST00000204910 2711 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm37772-201ENSMUST00000191635 1394 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Pde1c-208ENSMUST00000170774 2132 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm37937-201ENSMUST00000194130 2168 ntTSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 AC163660.4-201ENSMUST00000224983 2171 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Top2a-201ENSMUST00000068031 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm37283-201ENSMUST00000193111 1571 ntBASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Nsun4-202ENSMUST00000030475 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Rad21l-202ENSMUST00000180195 1659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.16□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Scn3a-202ENSMUST00000100069 8550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Mnd1-ps-202ENSMUST00000224435 2574 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Rubcnl-201ENSMUST00000036072 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Tmem229b-202ENSMUST00000070174 3656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 A930017M01Rik-201ENSMUST00000081361 2884 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 A330023F24Rik-202ENSMUST00000181273 4217 ntTSL 1 (best) BASIC7.15□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Zkscan7-204ENSMUST00000214957 5650 ntTSL 2 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Gm20486-201ENSMUST00000101544 128 ntBASIC7.15□□□□□ -1.26
Samd11Q1RNF8 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC7.15□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms