Protein–RNA interactions for Protein: P28705

Rxrg, Retinoic acid receptor RXR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxrgP28705 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 1700110I07Rik-201ENSMUST00000205487 726 ntTSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Amd-ps6-201ENSMUST00000214455 1003 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 AC166358.9-201ENSMUST00000220653 375 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm6056-201ENSMUST00000221253 488 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm18413-201ENSMUST00000221573 655 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 2310079G19Rik-201ENSMUST00000052337 881 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Scgb2b24-201ENSMUST00000055444 523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr447-201ENSMUST00000055763 933 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Ppih-201ENSMUST00000056458 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr352-201ENSMUST00000065416 948 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Tas2r104-201ENSMUST00000072404 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Mir143-201ENSMUST00000083511 63 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Il1rl2-204ENSMUST00000194296 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Tmem45a2-203ENSMUST00000227043 1447 ntAPPRIS P1 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 4732496C06Rik-201ENSMUST00000206533 2500 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Ccdc110-201ENSMUST00000095326 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm38299-201ENSMUST00000193214 3789 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Ddx58-201ENSMUST00000037907 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Csrnp3-204ENSMUST00000122912 10672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm42873-201ENSMUST00000196110 1726 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm43466-201ENSMUST00000197836 5214 ntBASIC5.88□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm34639-201ENSMUST00000222648 2241 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm32122-201ENSMUST00000212119 2259 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Ahnak-202ENSMUST00000092956 18099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Sirpb1c-203ENSMUST00000108350 2489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm37880-201ENSMUST00000192216 3257 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Alkbh8-204ENSMUST00000211933 7674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 BC055402-201ENSMUST00000190488 3301 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm38198-201ENSMUST00000191772 3581 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr341-201ENSMUST00000100154 942 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Mir449c-201ENSMUST00000102192 109 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm12887-201ENSMUST00000106265 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Csn3-202ENSMUST00000113267 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm11984-201ENSMUST00000118142 766 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm14229-201ENSMUST00000121178 850 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Pttg1-206ENSMUST00000121638 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm13838-201ENSMUST00000132130 531 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm15787-206ENSMUST00000141008 585 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm23669-201ENSMUST00000157470 128 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm15775-201ENSMUST00000159796 538 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Vmn1r91-201ENSMUST00000165330 924 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm16531-201ENSMUST00000180658 967 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm29551-201ENSMUST00000190913 698 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm37908-201ENSMUST00000195828 470 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 1700016F12Rik-201ENSMUST00000198159 655 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm44403-201ENSMUST00000198554 129 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm29791-201ENSMUST00000207144 380 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm44683-201ENSMUST00000209088 484 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm45701-201ENSMUST00000212049 235 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr1134-203ENSMUST00000213939 1015 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr697-202ENSMUST00000217734 1190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 AC108401.1-201ENSMUST00000219740 361 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 4930549C15Rik-201ENSMUST00000221235 1260 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 AC134254.2-201ENSMUST00000221262 170 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr1404-201ENSMUST00000056592 1034 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr1472-201ENSMUST00000077501 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr1475-201ENSMUST00000080801 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm7205-201ENSMUST00000196032 1323 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm12057-201ENSMUST00000117244 1427 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm28673-201ENSMUST00000186562 1498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm37344-203ENSMUST00000195490 1498 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Vmn1r8-203ENSMUST00000228690 1699 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Mboat2-204ENSMUST00000221952 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 P2ry13-201ENSMUST00000040622 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Vmn1r189-202ENSMUST00000227357 3245 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Agbl2-204ENSMUST00000111481 3448 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 AC132384.12-201ENSMUST00000219608 4227 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Bche-201ENSMUST00000029367 6210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 CT009757.5-201ENSMUST00000221858 3425 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm44043-201ENSMUST00000203426 3253 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Aspn-201ENSMUST00000021820 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm15478-201ENSMUST00000145914 2172 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Dnah14-209ENSMUST00000208001 13696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 AC153959.1-201ENSMUST00000213617 1694 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 5330411O13Rik-201ENSMUST00000205759 1544 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm31121-201ENSMUST00000197948 1413 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm23910-201ENSMUST00000104597 132 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 S100a9-202ENSMUST00000117167 519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm13451-201ENSMUST00000117649 592 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Olfr990-ps1-201ENSMUST00000120485 904 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm12494-201ENSMUST00000121684 521 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 1700057H15Rik-201ENSMUST00000127913 595 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm12256-201ENSMUST00000132394 446 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm11659-201ENSMUST00000137561 466 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Il2ra-202ENSMUST00000150890 1013 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 2810403D21Rik-206ENSMUST00000151166 1107 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm26352-201ENSMUST00000158223 125 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Gm24767-201ENSMUST00000158509 95 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
RxrgP28705 Pkib-211ENSMUST00000177473 525 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.7 ms