Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Itih4-203ENSMUST00000120269 3531 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Nceh1-201ENSMUST00000046515 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Cyp2j8-201ENSMUST00000124729 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm11346-201ENSMUST00000118346 704 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm16019-201ENSMUST00000149538 261 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Crem-235ENSMUST00000154705 529 ntTSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Smdt1-202ENSMUST00000159054 294 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm6047-201ENSMUST00000167221 574 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm21882-201ENSMUST00000178332 1083 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm27016-201ENSMUST00000183294 715 ntTSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm28153-201ENSMUST00000189853 629 ntTSL 3 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm20586-201ENSMUST00000210122 547 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm6863-201ENSMUST00000052882 636 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Glipr1l1-201ENSMUST00000073617 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Olfr1024-201ENSMUST00000099912 984 ntAPPRIS P1 BASIC5.77□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm45632-201ENSMUST00000211532 1888 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 CT009754.2-201ENSMUST00000221683 3661 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm37621-201ENSMUST00000194716 5531 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Itga2-201ENSMUST00000056117 7108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm44424-201ENSMUST00000203438 1826 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm37745-201ENSMUST00000193304 8163 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 4933430A20Rik-201ENSMUST00000210943 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Adam30-201ENSMUST00000050342 3510 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm19757-201ENSMUST00000205113 2946 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Olfr430-203ENSMUST00000214390 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Nlrp1a-202ENSMUST00000108518 3767 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Ndufaf4-201ENSMUST00000029925 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm15357-201ENSMUST00000119160 285 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm11369-201ENSMUST00000120812 318 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 2210408F21Rik-203ENSMUST00000133510 429 ntTSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 1700010I02Rik-201ENSMUST00000187729 438 ntTSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm29489-201ENSMUST00000188934 324 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm18329-201ENSMUST00000215832 589 ntBASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Olfr720-201ENSMUST00000035250 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Olfr148-201ENSMUST00000050807 1017 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm10112-201ENSMUST00000075226 354 ntAPPRIS P1 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Zfp950-207ENSMUST00000180544 2568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Olfr733-202ENSMUST00000214372 3530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 2610021A01Rik-201ENSMUST00000163475 4004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.76□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Cytip-201ENSMUST00000028175 6110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 4933423P22Rik-201ENSMUST00000126219 4595 ntTSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Amy2a3-201ENSMUST00000179314 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Amy2a4-201ENSMUST00000179568 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Akap9-201ENSMUST00000044492 13123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 AC151734.1-201ENSMUST00000227023 1740 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 St18-201ENSMUST00000043578 5862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm45358-201ENSMUST00000209492 2305 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Clasp1-210ENSMUST00000188710 10265 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm14212-201ENSMUST00000122023 826 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Rps10-ps3-201ENSMUST00000122317 500 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm12127-201ENSMUST00000123278 706 ntTSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Ssxb8-202ENSMUST00000185125 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm2367-201ENSMUST00000192374 472 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm44074-201ENSMUST00000204562 337 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 6720469O03Rik-201ENSMUST00000206785 1201 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Ap3m1-208ENSMUST00000224016 764 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Prss37-201ENSMUST00000031967 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Olfr827-201ENSMUST00000058123 1058 ntAPPRIS P1 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Olfr521-202ENSMUST00000219663 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm5891-202ENSMUST00000186212 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm10662-202ENSMUST00000186928 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Arhgap32-201ENSMUST00000168954 8703 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Mybpc1-202ENSMUST00000121629 3922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Hdlbp-204ENSMUST00000186164 3808 ntTSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gpalpp1-201ENSMUST00000022585 5389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm6526-201ENSMUST00000100643 1723 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Akap13-205ENSMUST00000207750 12597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Slc30a7-201ENSMUST00000067485 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Olfr62-203ENSMUST00000217013 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Olfr45-202ENSMUST00000214637 6157 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.75□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Vmn2r28-201ENSMUST00000086297 3785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Cfap221-201ENSMUST00000037840 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Olfr516-202ENSMUST00000216092 1493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Igkc-201ENSMUST00000103410 532 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm24578-201ENSMUST00000103970 129 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm13733-201ENSMUST00000117290 535 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm16345-201ENSMUST00000146065 158 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 4930535G08Rik-201ENSMUST00000192017 425 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Mir6516-201ENSMUST00000196236 110 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Gm36864-201ENSMUST00000205530 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 AC121986.1-201ENSMUST00000218588 781 ntBASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 AC124687.2-201ENSMUST00000221927 1228 ntTSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Ythdc1-201ENSMUST00000038384 2960 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Olfr1441-201ENSMUST00000059033 1088 ntAPPRIS P1 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Tank-201ENSMUST00000078074 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Fam49a-202ENSMUST00000069066 9452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 A230072E10Rik-202ENSMUST00000175825 3292 ntTSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Olfr1342-202ENSMUST00000216226 3269 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Mrgprb2-201ENSMUST00000052730 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Olfr447-202ENSMUST00000216408 3185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 1700019D03Rik-203ENSMUST00000114493 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Usp26-201ENSMUST00000069509 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.74□□□□□ -1.49
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