Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Zfp157-201ENSMUST00000085856 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm8402-201ENSMUST00000118183 1770 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm8383-201ENSMUST00000121179 1770 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm38082-201ENSMUST00000192800 6882 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm8734-201ENSMUST00000211669 1312 ntBASIC8.28□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Olfr57-202ENSMUST00000203906 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Pramel4-201ENSMUST00000084191 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Olfr119-202ENSMUST00000213732 1722 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 BC003331-201ENSMUST00000006167 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm12422-201ENSMUST00000121431 302 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm11958-201ENSMUST00000127224 253 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm26167-201ENSMUST00000158423 253 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm5558-201ENSMUST00000178933 495 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 1700108F19Rik-201ENSMUST00000185213 621 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm44174-201ENSMUST00000205022 141 ntTSL 2 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm45083-201ENSMUST00000205216 712 ntTSL 3 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm46102-201ENSMUST00000217005 731 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 AC160031.1-201ENSMUST00000219914 522 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm31747-201ENSMUST00000204638 3086 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Peak1-201ENSMUST00000061552 6996 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Kcnj15-202ENSMUST00000113854 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Ctnnd1-208ENSMUST00000111677 5789 ntTSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Scn3a-201ENSMUST00000066432 9560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Clrn3-201ENSMUST00000053716 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Psd4-202ENSMUST00000102942 11265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Phlpp2-203ENSMUST00000179721 7846 ntTSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Pgbd1-202ENSMUST00000122872 2965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm37106-201ENSMUST00000193760 1532 ntBASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Adamdec1-201ENSMUST00000022641 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Xpr1-201ENSMUST00000027741 7492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.27□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Zbbx-203ENSMUST00000107776 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Adcy10-201ENSMUST00000027852 5210 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Atf2-206ENSMUST00000112016 3943 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm22266-201ENSMUST00000104011 138 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm25726-201ENSMUST00000104529 129 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm15767-202ENSMUST00000153786 544 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm24961-201ENSMUST00000157918 184 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Mir7685-201ENSMUST00000183555 62 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm28935-201ENSMUST00000185737 568 ntTSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm45226-201ENSMUST00000206602 288 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm44650-201ENSMUST00000206929 194 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 1700054O05Rik-201ENSMUST00000214107 555 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 AC156790.5-201ENSMUST00000227075 231 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Fryl-202ENSMUST00000101127 11340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 B3gnt5-203ENSMUST00000121344 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Tfec-201ENSMUST00000031533 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gmeb1-207ENSMUST00000168553 6523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm44584-201ENSMUST00000208395 2880 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm5746-201ENSMUST00000183550 2200 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Dnajc15-202ENSMUST00000226459 6193 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Zfp488-201ENSMUST00000166737 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Vmn2r17-201ENSMUST00000171841 2550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Lmo3-204ENSMUST00000162772 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Olfr1352-201ENSMUST00000058991 4356 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm12285-201ENSMUST00000117347 233 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm15338-201ENSMUST00000151884 552 ntTSL 3 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm7040-201ENSMUST00000223271 443 ntBASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm10799-201ENSMUST00000099666 312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.26□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 March1-205ENSMUST00000110255 4177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Smc2-202ENSMUST00000117280 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Sox6-202ENSMUST00000106612 8193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Vav3-202ENSMUST00000106576 3123 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Adgrl2-220ENSMUST00000200543 5509 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm43197-201ENSMUST00000201493 2583 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Vmn1r171-205ENSMUST00000226771 2718 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Myof-201ENSMUST00000041475 6902 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm37926-201ENSMUST00000191922 2424 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 AC156636.2-201ENSMUST00000218845 4557 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Lars-201ENSMUST00000097590 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 9430037G07Rik-201ENSMUST00000180723 3177 ntTSL 1 (best) BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Vmn2r94-201ENSMUST00000172190 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Prom1-208ENSMUST00000179059 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Igkv10-94-201ENSMUST00000103330 347 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm24170-201ENSMUST00000104124 133 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Skint8-201ENSMUST00000106572 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm8145-201ENSMUST00000118220 745 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm7657-201ENSMUST00000118851 666 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm5942-201ENSMUST00000120046 439 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm12755-201ENSMUST00000122297 282 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm23993-201ENSMUST00000157478 144 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm37256-201ENSMUST00000193034 566 ntTSL 5 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 BX530055.1-201ENSMUST00000197285 122 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Olfr494-201ENSMUST00000209743 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Olfr494-202ENSMUST00000210291 947 ntAPPRIS P1 BASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC8.25□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Ctnnd1-224ENSMUST00000111698 5850 ntTSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Spag17os-201ENSMUST00000137776 2437 ntTSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Nrk-202ENSMUST00000113052 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Olfr470-203ENSMUST00000220193 3080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.24□□□□□ -1.09
PtprtQ99M80 Gbp2b-201ENSMUST00000029936 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.24□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms