Protein–RNA interactions for Protein: P28359

Hoxd10, Homeobox protein Hox-D10, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd10P28359 Ighv9-4-201ENSMUST00000103482 294 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm13023-202ENSMUST00000105770 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Defb45-201ENSMUST00000109834 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm14485-201ENSMUST00000119489 493 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm11990-201ENSMUST00000121505 897 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 4933401B06Rik-201ENSMUST00000139758 1155 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm20549-201ENSMUST00000174804 429 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 1110032A03Rik-209ENSMUST00000177546 647 ntTSL 3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 S100a11-ps-201ENSMUST00000181735 306 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Igkv15-101-201ENSMUST00000195917 299 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 4930487D11Rik-201ENSMUST00000201983 295 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Clec2j-202ENSMUST00000203658 606 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 5330439M10Rik-201ENSMUST00000218667 348 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm5457-201ENSMUST00000022260 333 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm13544-201ENSMUST00000131189 2940 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Mndal-201ENSMUST00000111210 1907 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Lifr-204ENSMUST00000226471 3392 ntAPPRIS P3 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Noct-202ENSMUST00000144826 9797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Zfp638-220ENSMUST00000204751 9033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 AC121844.3-201ENSMUST00000219124 1785 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm26791-201ENSMUST00000180942 1605 ntTSL 1 (best) BASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 AC144733.2-201ENSMUST00000222552 2292 ntBASIC6.36□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Dcun1d4-202ENSMUST00000087181 4117 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm10441-201ENSMUST00000200950 1546 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Spag5-201ENSMUST00000045026 3887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm17093-201ENSMUST00000170427 1404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Olfr1054-202ENSMUST00000213205 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Cnot1-203ENSMUST00000211887 8364 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm43031-201ENSMUST00000198500 1887 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Olfr1338-202ENSMUST00000214922 2947 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm42798-201ENSMUST00000200853 3972 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm7108-201ENSMUST00000118038 3407 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Cfap61-207ENSMUST00000138774 3308 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Olfr361-201ENSMUST00000100145 969 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Scgb1b22-ps-201ENSMUST00000116008 280 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Vmn1r-ps112-201ENSMUST00000117475 544 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm15171-201ENSMUST00000122191 334 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm12162-201ENSMUST00000123422 154 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Med9os-202ENSMUST00000139794 446 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm11846-201ENSMUST00000155156 515 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm11507-201ENSMUST00000156462 412 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm7609-204ENSMUST00000161424 461 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 C530050E15Rik-201ENSMUST00000181373 3837 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Sbp-205ENSMUST00000183017 700 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 1700027A15Rik-202ENSMUST00000188349 617 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm8999-201ENSMUST00000204951 969 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm3257-201ENSMUST00000207217 675 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 C230072F16Rik-203ENSMUST00000220322 1136 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 AC156572.1-201ENSMUST00000221040 1161 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 AC163646.1-201ENSMUST00000227704 397 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Olfr894-201ENSMUST00000093866 949 ntAPPRIS P2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Tnfaip3-202ENSMUST00000105527 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Zfp26-203ENSMUST00000159569 11276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm13057-201ENSMUST00000105776 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 C3ar1-201ENSMUST00000042081 4305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm20655-202ENSMUST00000181428 2946 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm8979-201ENSMUST00000183386 7296 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 AA792892-202ENSMUST00000202253 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Xrn1-201ENSMUST00000034981 5499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm21698-202ENSMUST00000191203 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Wdr17-209ENSMUST00000150488 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Ifi44-201ENSMUST00000029671 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Neb-201ENSMUST00000028320 10298 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 CT009734.1-201ENSMUST00000227657 1687 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Zan-201ENSMUST00000117564 16481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Mir678-201ENSMUST00000102114 84 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm11975-201ENSMUST00000118772 481 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm13147-201ENSMUST00000125785 585 ntTSL 2 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm15346-201ENSMUST00000143638 475 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Mog-202ENSMUST00000167275 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm3170-201ENSMUST00000168753 850 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm3348-201ENSMUST00000177813 850 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm22852-201ENSMUST00000177899 101 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm29650-201ENSMUST00000188485 742 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 2310043L19Rik-201ENSMUST00000189507 698 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 7420461P10Rik-203ENSMUST00000193898 545 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Gm7990-201ENSMUST00000212126 593 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 CU024910.1-201ENSMUST00000214310 418 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Rpl21-ps13-201ENSMUST00000072532 483 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Mrgprb3-201ENSMUST00000094383 1009 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Dusp16-204ENSMUST00000149776 3305 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Nfia-201ENSMUST00000052018 9249 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Hoxd10P28359 Vmn1r44-210ENSMUST00000227747 1811 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Fbxw22-201ENSMUST00000080626 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Olfr1386-203ENSMUST00000213674 2457 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 B130006D01Rik-201ENSMUST00000100534 3124 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Btbd35f6-201ENSMUST00000179466 1497 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Iqcb1-202ENSMUST00000114819 2797 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.4
Hoxd10P28359 Mug-ps1-201ENSMUST00000186891 4386 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.4 ms