Protein–RNA interactions for Protein: P28357

Hoxd9, Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

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Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9P28357 Mapk10-201ENSMUST00000086854 6630 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr1441-203ENSMUST00000216506 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 BC053393-201ENSMUST00000050937 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Obox3-206ENSMUST00000174443 1979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Wdr37-202ENSMUST00000054251 4626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Vip-201ENSMUST00000019906 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Zfp930-204ENSMUST00000212681 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr1045-202ENSMUST00000215763 2960 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm7361-201ENSMUST00000074148 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm38370-201ENSMUST00000192545 1499 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 4921524L21Rik-201ENSMUST00000044829 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm11853-201ENSMUST00000119687 1384 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Fbxw11-201ENSMUST00000076383 4019 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Pou1f1-204ENSMUST00000176330 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Lnpep-201ENSMUST00000041047 5181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Igkv1-122-201ENSMUST00000103314 383 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm25311-201ENSMUST00000104136 132 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm25498-201ENSMUST00000104424 129 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Vmn1r121-201ENSMUST00000105197 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm14897-201ENSMUST00000118213 207 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm12935-201ENSMUST00000119352 246 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm9085-201ENSMUST00000119994 1072 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm13357-201ENSMUST00000120528 537 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm12322-201ENSMUST00000121605 389 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Speer3-201ENSMUST00000124677 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 C230035I16Rik-201ENSMUST00000141543 623 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm14223-201ENSMUST00000146060 517 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm25970-201ENSMUST00000157165 86 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm22076-201ENSMUST00000158601 84 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm17022-201ENSMUST00000166415 922 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm4175-201ENSMUST00000172863 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm19932-201ENSMUST00000177033 313 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AF067061-201ENSMUST00000179905 1174 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 4933433F19Rik-201ENSMUST00000180571 1088 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm26570-201ENSMUST00000180672 342 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm27014-201ENSMUST00000182658 937 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Mir8118-201ENSMUST00000183962 129 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm27185-201ENSMUST00000184296 247 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Mir6987-201ENSMUST00000184789 73 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm29566-201ENSMUST00000190627 457 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm9989-202ENSMUST00000193125 258 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm43370-201ENSMUST00000196437 284 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm30517-201ENSMUST00000197350 772 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm17824-201ENSMUST00000197690 805 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Igkv4-77-201ENSMUST00000199410 352 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr717-ps1-201ENSMUST00000205589 556 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr1289-202ENSMUST00000207494 1014 ntAPPRIS P2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Olfr515-ps1-201ENSMUST00000208389 189 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC163661.1-201ENSMUST00000216546 910 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 CT486006.1-201ENSMUST00000216797 227 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm8613-201ENSMUST00000220383 1077 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC116589.2-201ENSMUST00000220469 478 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 CT010456.3-201ENSMUST00000221210 523 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC124489.1-201ENSMUST00000225852 526 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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Hoxd9P28357 Olfr623-201ENSMUST00000068531 1075 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Hoxd9P28357 Mir181a-2-201ENSMUST00000083489 76 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
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Hoxd9P28357 Spam1-202ENSMUST00000202331 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gjc3-201ENSMUST00000077119 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Hoxd9P28357 Pcbp2-201ENSMUST00000077037 2868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
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Hoxd9P28357 Trpm7-201ENSMUST00000028843 6985 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm14935-201ENSMUST00000121528 1708 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Vmn2r15-201ENSMUST00000167133 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 AC159002.2-201ENSMUST00000228843 4874 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Ccdc82-206ENSMUST00000217444 4736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Adgrf1-201ENSMUST00000047399 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm29198-201ENSMUST00000190102 1512 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Urb2-201ENSMUST00000034457 5853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gtf2h1-202ENSMUST00000107644 2187 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Csde1-201ENSMUST00000029446 4318 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm43523-201ENSMUST00000197397 2878 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm10610-202ENSMUST00000207184 2693 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Ccr9-201ENSMUST00000111454 2620 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm26416-201ENSMUST00000104280 134 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm8855-201ENSMUST00000118888 878 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm15019-201ENSMUST00000120148 434 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm14506-201ENSMUST00000121165 536 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm12152-201ENSMUST00000122465 684 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm26256-201ENSMUST00000122499 186 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm15521-201ENSMUST00000141752 835 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm12867-201ENSMUST00000151216 457 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
Hoxd9P28357 Gm26353-201ENSMUST00000158224 255 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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