Protein–RNA interactions for Protein: P11531

Dmd, Dystrophin, mousemouse

Predictions only

Length 3,678 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DmdP11531 Tmod2-202ENSMUST00000098552 9871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DmdP11531 Hormad1-204ENSMUST00000171191 1437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DmdP11531 B530045E10Rik-202ENSMUST00000189035 3138 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DmdP11531 Vcam1-201ENSMUST00000029574 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm12073-201ENSMUST00000117382 524 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm14288-202ENSMUST00000123863 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DmdP11531 4930551O13Rik-201ENSMUST00000145585 1065 ntTSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm43391-201ENSMUST00000196145 883 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm43309-201ENSMUST00000200837 458 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm21885-202ENSMUST00000208510 775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
DmdP11531 Mir20a-201ENSMUST00000083508 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DmdP11531 9230109A22Rik-202ENSMUST00000228644 1853 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
DmdP11531 Iqch-203ENSMUST00000163624 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Erich3-202ENSMUST00000098496 8280 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Crtam-204ENSMUST00000188848 5001 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Atp8b4-201ENSMUST00000040128 5693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Cacna1d-204ENSMUST00000223803 6435 ntAPPRIS ALT2 BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Lama5-201ENSMUST00000015791 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Vps29-203ENSMUST00000118765 713 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 2010013B24Rik-201ENSMUST00000126922 747 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm3084-201ENSMUST00000169967 598 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Esd-ps-201ENSMUST00000170684 847 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm35325-201ENSMUST00000208979 771 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 AC132384.6-201ENSMUST00000218976 1206 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Abca1-201ENSMUST00000030010 10262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Tep1-201ENSMUST00000006444 8171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gcnt3-201ENSMUST00000034751 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 AC159188.2-201ENSMUST00000224103 1301 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm38218-201ENSMUST00000193555 4689 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Slc26a9-201ENSMUST00000049027 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Lrrtm4-201ENSMUST00000074662 3383 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Lrrn3-201ENSMUST00000043884 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm29488-201ENSMUST00000191427 2402 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Ankrd6-201ENSMUST00000035719 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Synpo2-203ENSMUST00000106427 6937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 March6-201ENSMUST00000090227 6260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Trav10-201ENSMUST00000103583 406 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Mageb16-ps1-201ENSMUST00000117991 1127 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm45054-201ENSMUST00000206525 342 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Olfr1200-201ENSMUST00000099811 1011 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Olfr373-203ENSMUST00000215198 3923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Tsc1-202ENSMUST00000113867 7682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Sorbs2-201ENSMUST00000067065 6337 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Ttc39d-201ENSMUST00000053168 2022 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Tnik-205ENSMUST00000160307 4404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Pogz-205ENSMUST00000107270 6399 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Zhx3-202ENSMUST00000103112 9109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm11679-201ENSMUST00000121830 779 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm17081-201ENSMUST00000167363 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Vmn1r-ps22-201ENSMUST00000176017 900 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Obox4-ps11-201ENSMUST00000176150 724 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm7299-201ENSMUST00000194441 581 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 AC164597.1-201ENSMUST00000226538 514 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Olfr693-201ENSMUST00000057817 952 ntAPPRIS P1 BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm25592-201ENSMUST00000082635 131 ntBASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Trim30b-201ENSMUST00000106831 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm16041-201ENSMUST00000144339 3725 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm45084-201ENSMUST00000207096 1957 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 AC168056.3-201ENSMUST00000225395 2540 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Cacna1d-207ENSMUST00000224198 6564 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 C1s2-202ENSMUST00000218020 2662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 C1s2-201ENSMUST00000068797 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm43502-201ENSMUST00000200263 2596 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Prom1-207ENSMUST00000177946 3534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Mfsd4b4-201ENSMUST00000178045 3508 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 AL591843.1-201ENSMUST00000223686 3082 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Adgrl3-216ENSMUST00000121641 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm25419-201ENSMUST00000104215 191 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Smpx-203ENSMUST00000112521 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm8279-201ENSMUST00000112767 998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm37632-201ENSMUST00000191811 1142 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm3912-203ENSMUST00000211024 367 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Serpinb3b-202ENSMUST00000166100 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Cep170-215ENSMUST00000195717 6967 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Brcc3-202ENSMUST00000114074 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 CT025604.1-201ENSMUST00000221111 3436 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Vmn1r184-206ENSMUST00000228145 5888 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Olfr765-202ENSMUST00000216460 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm10727-201ENSMUST00000197107 1602 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Kidins220-202ENSMUST00000220459 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm15583-201ENSMUST00000116191 3510 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Zbtb43-202ENSMUST00000095035 4925 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Olfr404-ps1-201ENSMUST00000121065 972 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Llph-ps1-201ENSMUST00000121281 390 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Llph-ps2-201ENSMUST00000122000 393 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Cox6b2-209ENSMUST00000184143 435 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 AC120011.1-201ENSMUST00000202147 744 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm43580-201ENSMUST00000202892 284 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 Gm44993-201ENSMUST00000208435 842 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
DmdP11531 AC154198.1-201ENSMUST00000222839 424 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms