Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

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Length 1,739 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 AC131033.2-201ENSMUST00000228138 1011 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
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Col5a3Q9JLI2 2210418O10Rik-201ENSMUST00000099009 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Ptprd-219ENSMUST00000174531 4509 ntTSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Adgrb3-201ENSMUST00000041838 5059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Tnik-215ENSMUST00000162777 3894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Lair1-202ENSMUST00000086400 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Gm45406-201ENSMUST00000210161 1637 ntTSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Cyp4a28-ps-201ENSMUST00000121884 1477 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Vmn1r196-203ENSMUST00000227516 5122 ntBASIC5.78□□□□□ -1.48
Col5a3Q9JLI2 Csde1-206ENSMUST00000197488 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.78□□□□□ -1.48
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Col5a3Q9JLI2 Chrnb3-202ENSMUST00000079463 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Col5a3Q9JLI2 Defb30-202ENSMUST00000111207 989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 4930444P10Rik-201ENSMUST00000115367 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Col5a3Q9JLI2 Trpm6-201ENSMUST00000040489 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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Col5a3Q9JLI2 Gm44801-201ENSMUST00000207644 2060 ntBASIC5.77□□□□□ -1.49
Col5a3Q9JLI2 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.77□□□□□ -1.49
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