Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Fktn-203ENSMUST00000128667 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Mrps25-203ENSMUST00000140438 6073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Vmn2r-ps94-201ENSMUST00000116665 1456 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm14548-201ENSMUST00000070639 2128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Smg9Q9DB90 Gm45221-201ENSMUST00000207822 2272 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm340-201ENSMUST00000172371 3729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Cmtr2-201ENSMUST00000056972 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm36640-201ENSMUST00000203686 5934 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Smg9Q9DB90 Gp6-201ENSMUST00000108590 965 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Smg9Q9DB90 Gm12370-201ENSMUST00000117809 604 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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Smg9Q9DB90 Gm15527-202ENSMUST00000144094 770 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 1700080G11Rik-201ENSMUST00000156401 436 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Smg9Q9DB90 Trat1-201ENSMUST00000170861 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Smg9Q9DB90 1700025F22Rik-204ENSMUST00000181567 578 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm21392-201ENSMUST00000182950 972 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm27299-201ENSMUST00000184593 103 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 2310043O21Rik-201ENSMUST00000185323 622 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm28784-201ENSMUST00000187817 1011 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Smg9Q9DB90 Dpm2-201ENSMUST00000028151 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Creg1-201ENSMUST00000040298 425 ntTSL 3 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Fcer1a-201ENSMUST00000049706 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm7204-201ENSMUST00000062591 600 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 1700025F22Rik-201ENSMUST00000078770 650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Smg9Q9DB90 Gm23614-201ENSMUST00000082598 107 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm42949-201ENSMUST00000197054 2202 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Smg9Q9DB90 Ttc21b-202ENSMUST00000125446 4061 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Kcnmb2-201ENSMUST00000119310 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Rsf1os2-202ENSMUST00000147690 3091 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
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Smg9Q9DB90 Tmem236-201ENSMUST00000077517 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Col6a6-201ENSMUST00000060896 3954 ntTSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Zfp951-201ENSMUST00000089906 1356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Vwa3a-204ENSMUST00000166668 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Pus10-201ENSMUST00000020520 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Nostrin-201ENSMUST00000041865 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.06□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 CT025535.2-201ENSMUST00000228572 7441 ntBASIC7.06□□□□□ -1.28
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Smg9Q9DB90 Top3b-203ENSMUST00000119787 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Smg9Q9DB90 Lrriq3-202ENSMUST00000192383 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Smg9Q9DB90 Accs-203ENSMUST00000111246 3950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Smg9Q9DB90 Mir467h-201ENSMUST00000116759 121 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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Smg9Q9DB90 Gm22478-201ENSMUST00000122570 154 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gstm2-201ENSMUST00000012348 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
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Smg9Q9DB90 Gm13629-202ENSMUST00000152740 645 ntTSL 1 (best) BASIC7.05□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm18604-201ENSMUST00000172535 558 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm18522-201ENSMUST00000173947 650 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm26824-201ENSMUST00000180506 1164 ntTSL 5 BASIC7.05□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Klrb1-ps1-201ENSMUST00000184388 701 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm6074-201ENSMUST00000193340 451 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 Gm42465-201ENSMUST00000197036 492 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
Smg9Q9DB90 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC7.05□□□□□ -1.28
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