Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gnal-202ENSMUST00000076605 5223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Vmn1r30-202ENSMUST00000226334 1946 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm29536-201ENSMUST00000189296 3283 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 BC065397-203ENSMUST00000134066 3201 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Mdn1-201ENSMUST00000071642 17970 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Adgb-206ENSMUST00000208717 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Clk4-203ENSMUST00000109113 1627 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Tbl1xr1-201ENSMUST00000063988 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 CT009696.3-201ENSMUST00000215342 2184 ntTSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Slc22a27-201ENSMUST00000075619 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Olfr922-202ENSMUST00000213164 4028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 P2ry12-202ENSMUST00000170388 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Rbm46-203ENSMUST00000182818 2115 ntTSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Ktn1-209ENSMUST00000187262 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Prg4-206ENSMUST00000161611 3821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Arrdc3-205ENSMUST00000161441 1908 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm6902-201ENSMUST00000179072 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Fbxw26-201ENSMUST00000071917 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Ica1-202ENSMUST00000115518 1256 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm11270-201ENSMUST00000117685 471 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm15332-201ENSMUST00000118386 357 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm12925-203ENSMUST00000140510 665 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm24402-201ENSMUST00000157873 91 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm24179-201ENSMUST00000158925 127 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Mirt2-201ENSMUST00000175179 285 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm28934-201ENSMUST00000186491 346 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm6693-201ENSMUST00000189583 813 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Sult1c2-ps1-201ENSMUST00000200231 164 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm4602-201ENSMUST00000203198 308 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm5735-201ENSMUST00000207053 167 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm45185-201ENSMUST00000207556 404 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 AC119894.1-201ENSMUST00000220399 350 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm18591-201ENSMUST00000220568 763 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 CT956049.1-201ENSMUST00000225671 763 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm5612-201ENSMUST00000053326 375 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 1700013H16Rik-201ENSMUST00000067940 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Olfr313-201ENSMUST00000082220 1074 ntAPPRIS P1 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 n-R5-8s1-201ENSMUST00000083988 148 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Vmn1r36-201ENSMUST00000226142 1770 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Clk1-201ENSMUST00000034868 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Zbtb38-212ENSMUST00000152594 7406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Slamf7-203ENSMUST00000192195 3975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Ktn1-214ENSMUST00000188553 3918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Vmn2r5-201ENSMUST00000170270 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC5.84□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Trim12a-201ENSMUST00000070943 1531 ntTSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Kcnj2-201ENSMUST00000042970 5444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Olfr362-202ENSMUST00000213817 4059 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.84□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Olfr181-204ENSMUST00000205986 1891 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Trps1-202ENSMUST00000165201 9859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Ing3-201ENSMUST00000031680 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Vmn2r124-201ENSMUST00000176802 2568 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Epha3-201ENSMUST00000064405 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Klhl24-201ENSMUST00000023509 6683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 1700093K21Rik-204ENSMUST00000169264 1320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm13084-202ENSMUST00000105769 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm15781-201ENSMUST00000120216 323 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Olfr1021-ps1-201ENSMUST00000121914 1042 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Saxo1os-201ENSMUST00000131790 628 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm15522-201ENSMUST00000134467 785 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm26106-201ENSMUST00000157254 228 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm24741-201ENSMUST00000158857 106 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm10087-201ENSMUST00000167650 330 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 1700003H04Rik-206ENSMUST00000180162 1086 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm26923-201ENSMUST00000182615 996 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm27460-201ENSMUST00000184213 100 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Mir6361-201ENSMUST00000185079 101 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm28387-201ENSMUST00000189245 854 ntTSL 3 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm38040-201ENSMUST00000193505 225 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm17952-201ENSMUST00000193914 747 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm44206-201ENSMUST00000203044 592 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm44239-201ENSMUST00000204228 271 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm44307-201ENSMUST00000204466 764 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm45734-201ENSMUST00000211916 411 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm45910-201ENSMUST00000212493 1003 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm20786-201ENSMUST00000212649 436 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 CU062626.1-201ENSMUST00000225248 505 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Vmn1r22-205ENSMUST00000228322 909 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 1700003H04Rik-201ENSMUST00000047110 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Olfr1336-201ENSMUST00000056120 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Klrc3-201ENSMUST00000071149 715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm23737-201ENSMUST00000082547 159 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm43258-201ENSMUST00000200312 1950 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Ttc37-205ENSMUST00000224386 6976 ntAPPRIS P1 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm43526-201ENSMUST00000196666 1565 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Gm45555-201ENSMUST00000210028 2602 ntBASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Slc6a15-201ENSMUST00000074204 3607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 A330076H08Rik-202ENSMUST00000207694 1836 ntTSL 1 (best) BASIC5.83□□□□□ -1.48
Irx1P81068 Mef2c-202ENSMUST00000163888 6277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.83□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms