Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Gbp10-201ENSMUST00000065588 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Kcnj15-201ENSMUST00000037154 5089 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 A530053G22Rik-205ENSMUST00000205153 1448 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm3476-202ENSMUST00000167913 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm3149-202ENSMUST00000171810 1759 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Lyrm9-203ENSMUST00000147875 8035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 AC153971.1-201ENSMUST00000215097 3811 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Rbfox1-201ENSMUST00000056416 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Vps13a-201ENSMUST00000068156 10838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Ptgs2os-202ENSMUST00000181915 2937 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Naip2-202ENSMUST00000117913 4823 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm23839-201ENSMUST00000116957 109 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm13338-201ENSMUST00000120235 361 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm7840-201ENSMUST00000122086 533 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Olfr1038-ps-201ENSMUST00000149775 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 C920009B18Rik-203ENSMUST00000181643 1004 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm21856-201ENSMUST00000187547 696 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm28428-201ENSMUST00000188886 697 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm28769-201ENSMUST00000190176 615 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Ighv3-2-201ENSMUST00000191842 349 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm37088-201ENSMUST00000193887 406 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 6030400A10Rik-201ENSMUST00000199734 1212 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Zfp932-202ENSMUST00000112536 2509 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm37916-201ENSMUST00000192153 2435 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Olfr398-202ENSMUST00000117510 5135 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Hyal5-202ENSMUST00000200968 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm28394-201ENSMUST00000186805 1495 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Gm28570-201ENSMUST00000188300 1495 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 AC158596.1-201ENSMUST00000217315 2265 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Olfr1214-203ENSMUST00000217469 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 A330076C08Rik-201ENSMUST00000220765 5020 ntTSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
PtprtQ99M80 Slfn5-201ENSMUST00000067443 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Scn1a-202ENSMUST00000094951 5946 ntTSL 5 BASIC8.34□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Etnppl-201ENSMUST00000072271 4468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Olfr12-202ENSMUST00000213247 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm9733-201ENSMUST00000108361 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm27564-201ENSMUST00000185196 96 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm43418-201ENSMUST00000201334 428 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Olfr1077-ps1-201ENSMUST00000213225 1212 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm5045-201ENSMUST00000027054 810 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Chn1-202ENSMUST00000102677 3760 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Vmn2r-ps44-201ENSMUST00000174053 2412 ntBASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Sipa1l1-208ENSMUST00000222298 6179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Alkbh8-202ENSMUST00000165105 2256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm33027-201ENSMUST00000206093 4664 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gpatch8-206ENSMUST00000143842 6871 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 C030015A19Rik-201ENSMUST00000203368 2551 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Olfr328-203ENSMUST00000215717 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Med12-203ENSMUST00000117203 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm6584-201ENSMUST00000119671 447 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm13745-201ENSMUST00000121994 527 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm43678-201ENSMUST00000197774 328 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm43444-201ENSMUST00000198123 291 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm1715-201ENSMUST00000213681 1018 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Olfr646-201ENSMUST00000098182 939 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 AC158232.1-202ENSMUST00000218352 3343 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Zfp850-202ENSMUST00000180024 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 9530086O07Rik-201ENSMUST00000203503 2685 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Nrcam-201ENSMUST00000020939 4469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Vezt-201ENSMUST00000047711 4479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Cylc2-201ENSMUST00000041392 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Zfp974-201ENSMUST00000098639 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Eya4-208ENSMUST00000220299 3615 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Oprk1-203ENSMUST00000160339 2481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Tmprss11b-201ENSMUST00000038448 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm37076-201ENSMUST00000192033 2294 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Olfr976-202ENSMUST00000213171 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Trpc5os-202ENSMUST00000178233 3515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Ogdh-203ENSMUST00000093350 4075 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Ralgapa1-212ENSMUST00000226244 8841 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Pard3-212ENSMUST00000160717 4214 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Nsd2-202ENSMUST00000066854 6919 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm5963-201ENSMUST00000143451 236 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm23954-201ENSMUST00000157213 353 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm27896-201ENSMUST00000175162 317 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm8614-201ENSMUST00000182528 978 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Mir6414-201ENSMUST00000183685 82 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Ighv10-4-201ENSMUST00000193702 299 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 AC136146.1-201ENSMUST00000196180 91 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm29736-201ENSMUST00000198189 385 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm38944-201ENSMUST00000208218 512 ntTSL 2 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm7706-202ENSMUST00000211278 590 ntTSL 3 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 AC134860.4-201ENSMUST00000223592 978 ntBASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Olfr123-201ENSMUST00000054748 930 ntAPPRIS P1 BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Pgbd1-201ENSMUST00000099719 3283 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Fam205a4-201ENSMUST00000108026 4130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Ryr1-201ENSMUST00000032813 15352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Pum2-201ENSMUST00000020915 3587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Ube2u-201ENSMUST00000092730 1435 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 4921534A09Rik-201ENSMUST00000213976 2495 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Fmo9-201ENSMUST00000027843 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Patj-204ENSMUST00000107029 4342 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 A230107N01Rik-201ENSMUST00000180894 2348 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 C130089K02Rik-201ENSMUST00000194534 6960 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 9530036M11Rik-201ENSMUST00000138767 1996 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Gm37896-201ENSMUST00000195611 2791 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Mef2c-214ENSMUST00000197722 3517 ntTSL 5 BASIC8.31□□□□□ -1.08
PtprtQ99M80 Cep97-204ENSMUST00000121129 989 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.4 ms