Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

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Length 2,009 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm7316-201ENSMUST00000165395 445 ntBASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 1500004A13Rik-206ENSMUST00000184170 576 ntTSL 3 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 AC121264.1-201ENSMUST00000214412 269 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29154-234ENSMUST00000215272 750 ntTSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Defb13-201ENSMUST00000060587 452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Epha4-204ENSMUST00000188797 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl4-202ENSMUST00000113371 3566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Klhl4-201ENSMUST00000040504 3584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Cpa2-201ENSMUST00000096066 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Hbp1-201ENSMUST00000167458 2733 ntTSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr122-204ENSMUST00000217119 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr1026-203ENSMUST00000219615 1465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.05□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Slmap-201ENSMUST00000038522 4501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.05□□□□□ -1.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm24175-201ENSMUST00000158931 129 ntBASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 6330403N20Rik-201ENSMUST00000180467 1189 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm37381-201ENSMUST00000192427 899 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Eya4-202ENSMUST00000092665 5304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Olfr259-202ENSMUST00000213978 4046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Eya4-201ENSMUST00000074366 3488 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Ccdc88cQ6VGS5 1700084F23Rik-205ENSMUST00000191362 743 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm156-201ENSMUST00000095409 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Slfn4-203ENSMUST00000215472 1830 ntTSL 1 (best) BASIC6.04□□□□□ -1.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Amy2a2-201ENSMUST00000098667 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
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Ccdc88cQ6VGS5 Gm14769-201ENSMUST00000118590 432 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15657-203ENSMUST00000163077 779 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm2147-201ENSMUST00000193588 639 ntBASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr519-202ENSMUST00000202706 945 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm44110-201ENSMUST00000203871 475 ntTSL 2 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Gm34096-201ENSMUST00000211296 530 ntTSL 3 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Spata19-202ENSMUST00000214158 627 ntTSL 5 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr792-201ENSMUST00000076575 936 ntAPPRIS P1 BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Cnot4-202ENSMUST00000114989 3279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.03□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Vmn1r171-201ENSMUST00000078458 1581 ntAPPRIS P2 BASIC6.02□□□□□ -1.44
Ccdc88cQ6VGS5 Ska2-201ENSMUST00000020794 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
Ccdc88cQ6VGS5 C4bp-201ENSMUST00000027657 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
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