Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm14324-201ENSMUST00000121358 3051 ntBASIC6.34□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Maoa-201ENSMUST00000026013 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm10415-201ENSMUST00000204181 2825 ntTSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 AC164092.3-201ENSMUST00000216970 1323 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Lrrtm4-203ENSMUST00000126399 3050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Mfn1-202ENSMUST00000118286 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Olfr1302-202ENSMUST00000214708 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Ktn1-207ENSMUST00000186761 3902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm21292-201ENSMUST00000171947 1563 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm14836-201ENSMUST00000118567 471 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm15152-201ENSMUST00000121540 394 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 4930519D14Rik-201ENSMUST00000151471 1137 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm24236-201ENSMUST00000157794 134 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm24940-201ENSMUST00000158326 108 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Crxos-205ENSMUST00000171280 571 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Prl3c1-201ENSMUST00000018066 823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm16701-202ENSMUST00000180995 934 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Mir6417-201ENSMUST00000183815 116 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm28998-201ENSMUST00000186194 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm28576-201ENSMUST00000189007 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm37681-201ENSMUST00000193880 727 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm37719-201ENSMUST00000194615 292 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm6543-201ENSMUST00000197353 808 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm44969-201ENSMUST00000207829 549 ntTSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm44992-209ENSMUST00000209680 1083 ntTSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 CT025665.1-201ENSMUST00000215251 1199 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 AC155922.1-201ENSMUST00000220100 373 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 AC192333.6-201ENSMUST00000224565 725 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 AC157572.4-201ENSMUST00000228203 549 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 AC154323.1-201ENSMUST00000228329 1231 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 CT009600.1-201ENSMUST00000228771 337 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Glt6d1-201ENSMUST00000038010 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Olfr577-201ENSMUST00000051505 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm4861-201ENSMUST00000068546 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Olfr1337-201ENSMUST00000077247 951 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm22456-201ENSMUST00000082578 125 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Zfp758-202ENSMUST00000088765 2973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Olfr48-201ENSMUST00000099762 906 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Olfr1281-202ENSMUST00000208176 4905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Rfx3-202ENSMUST00000165566 9146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm44901-201ENSMUST00000208157 3977 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm8141-201ENSMUST00000190856 1723 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r2-201ENSMUST00000077958 2484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Cx3cr1-201ENSMUST00000064165 3753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm38137-201ENSMUST00000193735 1401 ntBASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Ube2v2-203ENSMUST00000115777 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.33□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Tbc1d23-201ENSMUST00000023431 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Iqch-204ENSMUST00000163982 3375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Scn1a-203ENSMUST00000112366 8386 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r71-210ENSMUST00000228561 4747 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Zfp9-201ENSMUST00000161170 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm45172-201ENSMUST00000206054 1301 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Ssmem1-201ENSMUST00000031797 1340 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Lrrc4c-202ENSMUST00000135431 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm13103-202ENSMUST00000105768 994 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm3943-201ENSMUST00000118606 718 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Ftx-201ENSMUST00000123841 673 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Zfp783-203ENSMUST00000130463 537 ntTSL 2 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm17223-201ENSMUST00000171413 481 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm8941-201ENSMUST00000181451 899 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm2914-201ENSMUST00000186120 328 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm28883-201ENSMUST00000189256 369 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm18969-201ENSMUST00000189423 730 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 1700047L14Rik-201ENSMUST00000189659 511 ntTSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm15754-202ENSMUST00000202846 758 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm4763-202ENSMUST00000205376 807 ntTSL 3 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 5033424D13Rik-201ENSMUST00000221779 648 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 AC164164.2-201ENSMUST00000221809 785 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 AC164295.2-201ENSMUST00000228539 757 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Rybp-ps-201ENSMUST00000069489 681 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Olfr568-201ENSMUST00000098216 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Siae-201ENSMUST00000002007 3339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm37690-202ENSMUST00000192684 1497 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm20287-201ENSMUST00000172848 2367 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm38128-201ENSMUST00000192085 3250 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Csde1-215ENSMUST00000199420 4185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 4930563J15Rik-201ENSMUST00000218306 3468 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Vmn2r104-201ENSMUST00000168050 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Rhbdd1-202ENSMUST00000140020 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm8822-201ENSMUST00000118948 2347 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Kat6b-ps2-201ENSMUST00000188339 1600 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm37051-201ENSMUST00000194535 2943 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm38590-202ENSMUST00000210654 1803 ntTSL 5 BASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 AC107645.1-201ENSMUST00000228660 1810 ntBASIC6.32□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Pot1a-201ENSMUST00000115327 2447 ntTSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm37049-201ENSMUST00000194356 1983 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm43567-201ENSMUST00000197581 1978 ntBASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 AC155941.5-201ENSMUST00000218925 1505 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Nsun6-201ENSMUST00000028034 2897 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Serpinb3b-201ENSMUST00000086694 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.31□□□□□ -1.4
Traf3ip1Q149C2 Gm37854-201ENSMUST00000192149 1463 ntTSL 5 BASIC6.31□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms