Protein–RNA interactions for Protein: P81068

Irx1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx1P81068 Gm18467-201ENSMUST00000208805 434 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 AC153357.1-201ENSMUST00000219190 482 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 1700048P04Rik-201ENSMUST00000219825 369 ntTSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 AC158633.1-201ENSMUST00000219892 649 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gnrh1-203ENSMUST00000223951 411 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 AC159205.4-201ENSMUST00000225964 704 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Mmp12-202ENSMUST00000065079 1185 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm10221-201ENSMUST00000088299 309 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Rnf213-202ENSMUST00000131035 16716 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm21693-202ENSMUST00000186047 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm3376-202ENSMUST00000186140 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm21704-202ENSMUST00000187277 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm10352-202ENSMUST00000187842 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm21677-202ENSMUST00000189592 1576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm35940-201ENSMUST00000213355 4797 ntTSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Olfr380-202ENSMUST00000121209 1669 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm6634-201ENSMUST00000180497 1804 ntTSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Zscan4-ps1-201ENSMUST00000165848 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Ccdc144b-203ENSMUST00000200469 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Vmn1r84-202ENSMUST00000226408 2898 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Nlrp4c-202ENSMUST00000121583 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.87□□□□□ -1.47
Irx1P81068 St18-210ENSMUST00000150761 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm16270-201ENSMUST00000160327 3238 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm14857-201ENSMUST00000117862 3185 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 D030025E07Rik-203ENSMUST00000197413 2346 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Abca13-201ENSMUST00000042740 16011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 AC154734.1-201ENSMUST00000219957 2141 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm28928-201ENSMUST00000187286 1443 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm5512-201ENSMUST00000218013 1353 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Aadac-201ENSMUST00000029325 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm5405-201ENSMUST00000120478 609 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm14135-201ENSMUST00000135438 591 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Runx2os3-201ENSMUST00000160203 738 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm8582-201ENSMUST00000164061 789 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Clec4e-207ENSMUST00000177367 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm15257-201ENSMUST00000177680 883 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm15252-201ENSMUST00000177750 883 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm15256-201ENSMUST00000177793 883 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm25065-201ENSMUST00000177914 132 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm15260-201ENSMUST00000179402 883 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm25891-201ENSMUST00000180050 132 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm38133-201ENSMUST00000195109 815 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm44360-201ENSMUST00000200081 82 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm43596-201ENSMUST00000202818 884 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm20997-201ENSMUST00000205148 231 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm6906-201ENSMUST00000218014 569 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm9088-201ENSMUST00000220237 508 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Zfand4-204ENSMUST00000221069 501 ntTSL 3 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 AC137950.3-201ENSMUST00000228250 246 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm22126-201ENSMUST00000083244 142 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Olfr556-201ENSMUST00000098219 1023 ntAPPRIS P1 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Foxr2-201ENSMUST00000096265 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Lrrc4c-203ENSMUST00000162807 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Olfr877-202ENSMUST00000213956 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Ptprd-217ENSMUST00000174023 4530 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Slc39a12-202ENSMUST00000114731 2648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Phkb-201ENSMUST00000053771 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm43164-201ENSMUST00000202529 2128 ntBASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Il1rapl2-201ENSMUST00000075471 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Olfr720-203ENSMUST00000216079 4692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm39327-201ENSMUST00000213594 1982 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Usp25-201ENSMUST00000023580 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Slc19a3-201ENSMUST00000045560 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Prrc2c-202ENSMUST00000182149 11289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Vmn1r175-202ENSMUST00000228383 2878 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm9577-201ENSMUST00000174655 2620 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm42600-201ENSMUST00000202081 3588 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Cep57l1-201ENSMUST00000019951 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Usp46-202ENSMUST00000119154 4738 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm3033-201ENSMUST00000112792 438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Rc3h2-202ENSMUST00000112934 8948 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm12488-201ENSMUST00000122449 499 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 2310081O03Rik-201ENSMUST00000128591 759 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm24733-201ENSMUST00000158863 253 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm7266-201ENSMUST00000187999 405 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm38097-201ENSMUST00000192936 439 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm37030-201ENSMUST00000194254 295 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm38360-201ENSMUST00000195130 454 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm43315-201ENSMUST00000198120 313 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm44312-201ENSMUST00000203536 469 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Fxyd1-207ENSMUST00000205778 438 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm45579-201ENSMUST00000209367 887 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm31432-201ENSMUST00000214727 538 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm18997-201ENSMUST00000216353 822 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 4930529N20Rik-201ENSMUST00000220538 639 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 CT009754.4-201ENSMUST00000221430 565 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 AC121947.1-201ENSMUST00000221755 1145 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 1700007K09Rik-201ENSMUST00000033146 360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm5830-201ENSMUST00000049117 443 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Gm8526-201ENSMUST00000079153 475 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Ccdc68-202ENSMUST00000080050 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Scfd1-201ENSMUST00000021335 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
Irx1P81068 Vmn1r20-202ENSMUST00000227909 3709 ntAPPRIS P1 BASIC5.85□□□□□ -1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms