Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm29663-201ENSMUST00000186962 853 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm36999-201ENSMUST00000192756 1046 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm37177-201ENSMUST00000193768 417 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Ighv1-14-201ENSMUST00000194015 402 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Rrh-208ENSMUST00000200079 1106 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Tpt1-ps4-201ENSMUST00000210908 503 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm36367-201ENSMUST00000217623 1158 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm34574-201ENSMUST00000217795 1240 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr518-202ENSMUST00000217803 2994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 4930407I19Rik-201ENSMUST00000220265 923 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 3830408C21Rik-204ENSMUST00000224838 714 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Cst12-201ENSMUST00000028932 644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Rps19-ps4-201ENSMUST00000091925 438 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Clca3a1-202ENSMUST00000059091 3524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Wrn-201ENSMUST00000033990 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Tbx22-204ENSMUST00000168403 1715 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Tinag-201ENSMUST00000034911 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm18508-201ENSMUST00000215790 1642 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Zscan4-ps2-201ENSMUST00000091440 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm6645-201ENSMUST00000118505 2726 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr1489-202ENSMUST00000217182 11140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm43283-201ENSMUST00000199138 2548 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Lrrc9-206ENSMUST00000162159 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr78-201ENSMUST00000060187 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Ush2a-201ENSMUST00000060479 15695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm15675-201ENSMUST00000130486 3681 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Piga-202ENSMUST00000112255 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm43462-201ENSMUST00000200265 3648 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr684-202ENSMUST00000215552 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr684-204ENSMUST00000217136 3182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 AC158115.2-201ENSMUST00000221804 5563 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Als2cr12-203ENSMUST00000188772 1382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm37959-201ENSMUST00000191700 2897 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm44255-201ENSMUST00000203456 2053 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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Ccl20O89093 Gm13090-201ENSMUST00000105667 746 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Ccl20O89093 Gm14805-201ENSMUST00000120172 340 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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Ccl20O89093 Gm8761-201ENSMUST00000121507 955 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm11528-201ENSMUST00000156822 914 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Ccl20O89093 Gm24369-201ENSMUST00000175387 96 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm26863-201ENSMUST00000181144 624 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm27820-201ENSMUST00000183628 175 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm27219-201ENSMUST00000184633 742 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm28238-201ENSMUST00000188102 383 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 1810012K16Rik-201ENSMUST00000190830 547 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm28640-201ENSMUST00000190918 550 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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Ccl20O89093 Clec9a-201ENSMUST00000058352 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Ccl20O89093 Gm13648-201ENSMUST00000138361 1536 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm1527-201ENSMUST00000099170 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Ccl20O89093 Gm20756-202ENSMUST00000201324 1565 ntTSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
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Ccl20O89093 Slc5a12-202ENSMUST00000111026 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Vmn2r115-201ENSMUST00000168175 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Cnot4-203ENSMUST00000114993 3473 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr341-202ENSMUST00000213300 6634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Olfr1306-202ENSMUST00000214844 1893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Galnt1-208ENSMUST00000178605 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Igkv4-68-201ENSMUST00000103350 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Igkv4-57-1-201ENSMUST00000103356 373 ntAPPRIS P1 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm42674-201ENSMUST00000107330 446 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm16394-201ENSMUST00000117289 675 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm14985-201ENSMUST00000118693 786 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Hspe1-ps4-201ENSMUST00000119538 286 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm11484-201ENSMUST00000119808 338 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Rps19-ps14-201ENSMUST00000121832 269 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm14237-201ENSMUST00000122080 430 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Eif5al3-ps-201ENSMUST00000135410 447 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Spdya-203ENSMUST00000144142 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 1700109G15Rik-201ENSMUST00000150735 384 ntTSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm22636-201ENSMUST00000158142 275 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm16139-201ENSMUST00000160015 420 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm20490-201ENSMUST00000173622 198 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm22411-201ENSMUST00000175462 126 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm22002-201ENSMUST00000175622 125 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm3696-202ENSMUST00000179898 612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Pafah1b1-ps1-201ENSMUST00000181263 1046 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
Ccl20O89093 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
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