Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Rasef-201ENSMUST00000058292 5183 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Adgrf5-201ENSMUST00000113599 8535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Nlrp10-201ENSMUST00000055745 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Tlr4-201ENSMUST00000048096 4077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Defb47-201ENSMUST00000100492 359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Igkv4-92-201ENSMUST00000103332 351 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm12685-201ENSMUST00000121702 214 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm16725-201ENSMUST00000138744 1253 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm5946-201ENSMUST00000182340 970 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Ighv1-19-1-201ENSMUST00000192823 351 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm18036-201ENSMUST00000195256 272 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Ighv1-35-201ENSMUST00000195265 351 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm43507-201ENSMUST00000196411 675 ntTSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm19169-201ENSMUST00000220109 1246 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm1000-201ENSMUST00000220520 801 ntTSL 3 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Rpl29-ps2-202ENSMUST00000220540 1165 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Rpl29-ps2-203ENSMUST00000222043 1036 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 AC129085.4-201ENSMUST00000224536 570 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 CT010486.1-201ENSMUST00000224609 422 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Zfp429-203ENSMUST00000224684 524 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Olfr1406-201ENSMUST00000072395 1063 ntAPPRIS P1 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Spink7-201ENSMUST00000076194 258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Stxbp3-ps-201ENSMUST00000090527 758 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Plekhg1-201ENSMUST00000042438 7190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm28672-201ENSMUST00000188727 1490 ntTSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Dsc1-201ENSMUST00000038710 3775 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Zfp148-ps1-201ENSMUST00000211201 2453 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Mtus1-203ENSMUST00000093534 4148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Nlrp4g-201ENSMUST00000067621 2030 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Nol8-201ENSMUST00000021824 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 CT025675.1-201ENSMUST00000228171 1567 ntBASIC5.56□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Chrna6-201ENSMUST00000033882 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Mapk10-203ENSMUST00000112847 7196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Olfr771-202ENSMUST00000214271 2098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Ugt2b35-201ENSMUST00000031186 3359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Olfr465-ps1-201ENSMUST00000206324 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Fbxw25-201ENSMUST00000163839 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Mir1188-201ENSMUST00000116756 120 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm15490-201ENSMUST00000119894 387 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm23546-201ENSMUST00000158211 137 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm8362-202ENSMUST00000170673 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Vmn1r-ps60-201ENSMUST00000173467 852 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 B230110C06Rik-202ENSMUST00000181936 938 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm28782-201ENSMUST00000185980 414 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm29284-201ENSMUST00000188363 255 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gatad1-204ENSMUST00000196304 704 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm35648-201ENSMUST00000202304 475 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm18468-201ENSMUST00000207321 369 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm18470-201ENSMUST00000207467 420 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm18465-201ENSMUST00000207468 369 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm18464-201ENSMUST00000207803 420 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm18458-201ENSMUST00000207908 369 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm18461-201ENSMUST00000208421 420 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm45524-201ENSMUST00000211374 1250 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm18940-201ENSMUST00000222518 871 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm6474-201ENSMUST00000223250 699 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 AC154755.1-201ENSMUST00000225244 537 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Mir337-201ENSMUST00000083592 97 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Rbm46os-201ENSMUST00000131274 3261 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Heph-202ENSMUST00000079322 3904 ntTSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Olfr1305-203ENSMUST00000213737 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Clec4a2-202ENSMUST00000041779 2481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Zscan4e-202ENSMUST00000210521 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Vmn1r77-202ENSMUST00000226525 8252 ntAPPRIS ALT2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gcnt2-203ENSMUST00000110191 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Atp2c1-202ENSMUST00000085133 4665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Vmn1r90-204ENSMUST00000226802 7185 ntAPPRIS P2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 AC120375.1-201ENSMUST00000227034 3612 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Il1a-201ENSMUST00000028882 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Zfp937-201ENSMUST00000073782 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Olfr610-203ENSMUST00000217627 1643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Sytl2-202ENSMUST00000107210 3718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Zfp934-203ENSMUST00000220648 2439 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Psg28-201ENSMUST00000019291 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Defb30-201ENSMUST00000100490 307 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Mir546-201ENSMUST00000102105 121 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Hbb-bh3-201ENSMUST00000118954 266 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm11636-201ENSMUST00000152172 774 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm5139-201ENSMUST00000175943 249 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm27754-201ENSMUST00000183340 126 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Mir6539-201ENSMUST00000183732 110 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm35189-201ENSMUST00000219319 789 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 AC102569.1-204ENSMUST00000222816 793 ntTSL 3 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Fxyd3-201ENSMUST00000072331 439 ntTSL 2 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Vmn1r177-201ENSMUST00000073967 930 ntAPPRIS P1 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Mir134-201ENSMUST00000083492 71 ntBASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm5941-201ENSMUST00000096371 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Wfdc9-201ENSMUST00000099095 252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.55□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm43485-201ENSMUST00000199292 1710 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 C230071H17Rik-201ENSMUST00000196044 2973 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Gm43282-201ENSMUST00000201848 2157 ntBASIC5.54□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Agl-201ENSMUST00000040603 9625 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.54□□□□□ -1.52
OtofQ9ESF1 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.54□□□□□ -1.52
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