Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Skap2-205ENSMUST00000204778 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gga3Q8BMI3 AC160028.2-201ENSMUST00000218937 2519 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Gga3Q8BMI3 Cd44-203ENSMUST00000099673 2848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gga3Q8BMI3 Nfib-201ENSMUST00000050872 8770 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gga3Q8BMI3 AC124183.1-201ENSMUST00000222367 2135 ntBASIC6.46□□□□□ -1.37
Gga3Q8BMI3 Fchsd2-202ENSMUST00000098250 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.37
Gga3Q8BMI3 Elavl4-201ENSMUST00000102722 4107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Elavl4-203ENSMUST00000106597 4149 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm16007-201ENSMUST00000117837 286 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Olfr1376-ps1-201ENSMUST00000121306 955 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm7309-201ENSMUST00000121670 581 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm12293-201ENSMUST00000121898 590 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm15848-203ENSMUST00000136015 482 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm11466-201ENSMUST00000148017 291 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 AC122858.3-202ENSMUST00000161721 433 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Slc19a3-203ENSMUST00000164473 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Il7-201ENSMUST00000168269 2307 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm18343-201ENSMUST00000172802 604 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm26909-201ENSMUST00000181668 627 ntTSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm26970-201ENSMUST00000182990 964 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm29596-201ENSMUST00000185710 385 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Scgb3a2-202ENSMUST00000187157 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm29288-201ENSMUST00000191582 901 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 C030018K13Rik-201ENSMUST00000196527 866 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm43712-201ENSMUST00000198020 291 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm42776-201ENSMUST00000198031 406 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm43745-201ENSMUST00000198085 1883 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm45845-201ENSMUST00000207326 582 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 AC153968.2-201ENSMUST00000215579 1140 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 1700020D12Rik-201ENSMUST00000221140 426 ntTSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 CT025579.3-201ENSMUST00000224543 451 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 AC102542.1-201ENSMUST00000225204 1138 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 AC154424.1-201ENSMUST00000225883 799 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 AC122858.1-201ENSMUST00000226212 433 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 AC122858.3-201ENSMUST00000226341 740 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 AC124408.2-201ENSMUST00000228168 645 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 AC156016.5-201ENSMUST00000228742 355 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Agr3-201ENSMUST00000042101 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Olfr855-201ENSMUST00000061693 992 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Fpr-rs6-201ENSMUST00000095636 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Olfr1275-201ENSMUST00000099620 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Usp47-202ENSMUST00000210309 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm37137-201ENSMUST00000195138 2684 ntBASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Fap-208ENSMUST00000174234 2211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Sdr16c6-202ENSMUST00000108383 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Zfp994-201ENSMUST00000179996 4880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Ctsm-201ENSMUST00000099451 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Olfr373-202ENSMUST00000213940 4145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Vmn2r88-204ENSMUST00000228139 3227 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Olfr535-204ENSMUST00000214296 5120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.46□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm37775-201ENSMUST00000194120 2313 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Vmn1r34-203ENSMUST00000226910 2982 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Vmn1r201-202ENSMUST00000226330 4770 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Olfr488-202ENSMUST00000211508 4624 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Olfr488-203ENSMUST00000215173 4605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm20644-201ENSMUST00000176721 2063 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Cdh17-202ENSMUST00000108303 3287 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Slc24a2-203ENSMUST00000107157 10531 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm37429-201ENSMUST00000193807 1799 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Rpl23a-ps4-201ENSMUST00000121008 455 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Mettl4-ps1-201ENSMUST00000127676 1272 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 1700019G24Rik-201ENSMUST00000130004 503 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm11197-201ENSMUST00000145158 839 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm16096-202ENSMUST00000149386 819 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm14233-201ENSMUST00000149576 439 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm21973-201ENSMUST00000157020 358 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Bhlhe40-202ENSMUST00000163617 476 ntTSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Rps8-ps1-201ENSMUST00000172445 624 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Vmn1r60-201ENSMUST00000173782 1007 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Vmn2r-ps32-201ENSMUST00000175794 757 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Vmn2r-ps3-201ENSMUST00000176077 1101 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm3307-201ENSMUST00000176164 632 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Prl3c1-203ENSMUST00000178072 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Scgb2b12-201ENSMUST00000183195 511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm28925-201ENSMUST00000188586 168 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Ms4a2-205ENSMUST00000189641 647 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm44184-201ENSMUST00000204290 132 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm44296-201ENSMUST00000204689 681 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Olfr1353-202ENSMUST00000204849 1015 ntAPPRIS P1 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm34549-202ENSMUST00000207356 970 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Axdnd1-210ENSMUST00000212747 1238 ntTSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Rab7-ps1-201ENSMUST00000213253 622 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm6980-201ENSMUST00000214327 1003 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 AC124445.1-201ENSMUST00000218613 452 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 AC126554.2-201ENSMUST00000223259 400 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm5087-204ENSMUST00000225820 645 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Ms4a2-201ENSMUST00000025583 1211 ntTSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Trappc1-201ENSMUST00000060956 628 ntTSL 3 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Rpl29-ps2-201ENSMUST00000086508 478 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Spink13-201ENSMUST00000097557 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Sox6-204ENSMUST00000166877 8079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Kcnmb2-202ENSMUST00000119970 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Sspo-202ENSMUST00000169350 15571 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Zfp280d-201ENSMUST00000098576 4387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.45□□□□□ -1.38
Gga3Q8BMI3 Akt3-202ENSMUST00000111159 4906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.45□□□□□ -1.38
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