Protein–RNA interactions for Protein: P55194

Sh3bp1, SH3 domain-binding protein 1, mousemouse

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Length 680 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp1P55194 Skint11-204ENSMUST00000164297 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Stx17-202ENSMUST00000107720 5770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm37779-201ENSMUST00000194221 3380 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Cdh17-201ENSMUST00000029871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr387-ps1-201ENSMUST00000134773 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Vmn1r203-202ENSMUST00000227520 8227 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm7240-204ENSMUST00000222847 2239 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Usp26-202ENSMUST00000114869 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Il31ra-201ENSMUST00000051756 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Nlrp4a-204ENSMUST00000146907 3479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Vmn1r208-202ENSMUST00000227136 3156 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm38085-201ENSMUST00000195785 3062 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Vmn1r203-203ENSMUST00000228889 8213 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Filip1l-201ENSMUST00000099667 1576 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm28074-201ENSMUST00000190424 1497 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr612-201ENSMUST00000104879 972 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Rpl36a-201ENSMUST00000113211 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 B4galt4-202ENSMUST00000114708 734 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm22952-201ENSMUST00000116720 120 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm13818-201ENSMUST00000119441 511 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm14294-201ENSMUST00000119749 751 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm12066-201ENSMUST00000123592 443 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm24359-201ENSMUST00000158418 221 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm23116-201ENSMUST00000158481 67 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Rpain-213ENSMUST00000178822 566 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 BC065403-201ENSMUST00000180997 1022 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm27240-201ENSMUST00000183616 677 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm37265-201ENSMUST00000191698 885 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm6119-201ENSMUST00000193443 1206 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm43470-201ENSMUST00000196175 454 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Rpl7-ps7-201ENSMUST00000200912 799 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm18290-201ENSMUST00000202900 844 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm5306-201ENSMUST00000203325 757 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm6009-201ENSMUST00000210848 280 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm2961-201ENSMUST00000211074 772 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm5831-201ENSMUST00000216016 1209 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Trdn-202ENSMUST00000217779 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 AC121804.1-201ENSMUST00000221016 394 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 AC122459.2-201ENSMUST00000227099 638 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gkn3-201ENSMUST00000032127 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr690-201ENSMUST00000061920 1062 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr826-201ENSMUST00000078322 942 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm22300-201ENSMUST00000082661 126 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Vmn1r90-206ENSMUST00000227566 6901 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Vmn2r3-202ENSMUST00000176328 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Ryr3-210ENSMUST00000208151 15370 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr911-ps1-202ENSMUST00000216496 3576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gabrq-201ENSMUST00000033711 2000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm18719-201ENSMUST00000196696 1413 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm38368-201ENSMUST00000193181 1335 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 AC151904.4-201ENSMUST00000219868 1319 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Vmn2r5-202ENSMUST00000177184 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm12185-201ENSMUST00000059930 5252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Vmn1r12-203ENSMUST00000227581 6490 ntAPPRIS ALT2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm19093-201ENSMUST00000210671 1454 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 4933439N06Rik-201ENSMUST00000203062 1365 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Rspry1-205ENSMUST00000211983 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 9230009I02Rik-201ENSMUST00000101255 1148 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Igkv4-79-201ENSMUST00000103342 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Trav6-6-201ENSMUST00000103584 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Trav6n-5-201ENSMUST00000103611 338 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Zfp971-201ENSMUST00000108925 923 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm14098-201ENSMUST00000119295 623 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm12115-201ENSMUST00000119969 447 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr1004-ps1-201ENSMUST00000120361 580 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm13291-201ENSMUST00000143527 655 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Wfdc15b-203ENSMUST00000164567 497 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm20506-201ENSMUST00000172952 589 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Trav6d-7-201ENSMUST00000178650 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Trav6n-7-201ENSMUST00000179607 358 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Mir7072-201ENSMUST00000184542 60 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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Sh3bp1P55194 Trav6d-6-201ENSMUST00000197754 344 ntAPPRIS P1 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm43717-201ENSMUST00000198684 310 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm18009-201ENSMUST00000203239 1016 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm18839-201ENSMUST00000204292 670 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm7499-201ENSMUST00000210423 813 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm45798-201ENSMUST00000212370 511 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 CT009748.2-201ENSMUST00000213828 1082 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 AC091522.1-201ENSMUST00000213934 850 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Camta1-213ENSMUST00000214673 243 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr1233-203ENSMUST00000215469 1205 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr1092-ps1-201ENSMUST00000216544 398 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr1233-204ENSMUST00000216561 1192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm4803-201ENSMUST00000218729 1279 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Mir194-1-201ENSMUST00000083647 67 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Zfp970-201ENSMUST00000099002 794 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Gm14391-201ENSMUST00000099028 473 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Ptprq-201ENSMUST00000050702 7393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 BC051142-202ENSMUST00000097348 1732 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Olfr1295-203ENSMUST00000217772 5539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
Sh3bp1P55194 Ap5m1-208ENSMUST00000228238 3514 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
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