Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Mir7012-201ENSMUST00000183900 64 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm8480-201ENSMUST00000190350 698 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Snhg1-211ENSMUST00000206155 605 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Cd209a-204ENSMUST00000208960 844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm18924-201ENSMUST00000211929 316 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 AC161609.1-201ENSMUST00000225878 474 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 AC096628.1-201ENSMUST00000226060 641 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 AC165953.1-201ENSMUST00000226386 357 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Olfr1367-201ENSMUST00000059216 1055 ntAPPRIS P1 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Mup13-201ENSMUST00000072678 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 n-R5s88-201ENSMUST00000083173 118 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Mup15-201ENSMUST00000095049 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 AC163731.1-201ENSMUST00000225696 3118 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Atp2b1-201ENSMUST00000020107 7130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm17137-201ENSMUST00000164106 4371 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Serpinb5-203ENSMUST00000112730 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm13919-202ENSMUST00000140238 1552 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Mbd3l2-201ENSMUST00000051008 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Scn8a-205ENSMUST00000108910 11232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Pias1-201ENSMUST00000098651 5564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Dock2-203ENSMUST00000101365 3785 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Cmah-208ENSMUST00000224819 9482 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm24350-201ENSMUST00000104163 133 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Meig1-202ENSMUST00000115081 421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm12641-201ENSMUST00000117874 985 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm12654-201ENSMUST00000120387 587 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm12519-201ENSMUST00000134099 693 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm25655-201ENSMUST00000158465 290 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm3242-201ENSMUST00000171273 485 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm20674-201ENSMUST00000177452 369 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm28363-201ENSMUST00000186341 673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 AC153548.2-201ENSMUST00000219770 885 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Vmn2r-ps92-201ENSMUST00000220242 388 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Olfr640-201ENSMUST00000084799 945 ntAPPRIS P1 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm44660-201ENSMUST00000207134 2465 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm37611-201ENSMUST00000195250 2028 ntBASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Rlim-201ENSMUST00000070705 7429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Olfr204-202ENSMUST00000216261 5371 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Shroom4-201ENSMUST00000089520 8201 ntTSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Olfr328-204ENSMUST00000216725 2904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Olfr553-202ENSMUST00000216776 3972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Cntn1-202ENSMUST00000068378 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Kidins220-201ENSMUST00000066652 7409 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm39043-201ENSMUST00000207602 2081 ntTSL 5 BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Zfp345-201ENSMUST00000109914 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Arhgef12-201ENSMUST00000072767 10059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.82□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 2610203C20Rik-206ENSMUST00000181814 2996 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 AC153729.1-201ENSMUST00000214055 2562 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 9830132P13Rik-201ENSMUST00000198240 4187 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm23692-201ENSMUST00000101881 160 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm23274-201ENSMUST00000104056 130 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm15971-201ENSMUST00000119372 211 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm8215-201ENSMUST00000120627 990 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm4845-201ENSMUST00000179202 562 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm26763-201ENSMUST00000180968 1093 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Pou6f2-206ENSMUST00000184299 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 9430087B13Rik-201ENSMUST00000196548 1085 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Mir409-201ENSMUST00000198153 79 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm43698-202ENSMUST00000202864 555 ntTSL 3 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm44108-201ENSMUST00000203525 422 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm7333-201ENSMUST00000213449 1060 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 AC124420.1-201ENSMUST00000219779 791 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 AC152169.2-201ENSMUST00000224558 613 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Glycam1-203ENSMUST00000228060 528 ntAPPRIS ALT2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Olfr1261-201ENSMUST00000077785 921 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 AC116726.1-201ENSMUST00000215028 3497 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Atp13a5-203ENSMUST00000143373 3789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Nxt2-203ENSMUST00000112914 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm43874-201ENSMUST00000204853 2798 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Dopey1-201ENSMUST00000034987 8933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Clca1-201ENSMUST00000029919 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Birc6-204ENSMUST00000182133 14604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Birc6-215ENSMUST00000182597 14649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Birc6-220ENSMUST00000182944 14610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 AC166344.3-203ENSMUST00000228117 1466 ntAPPRIS P1 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Slfn4-201ENSMUST00000000208 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Rsrc2-203ENSMUST00000111515 4223 ntTSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Pirt-201ENSMUST00000123434 4200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm37902-201ENSMUST00000192839 1683 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm38118-201ENSMUST00000192052 2222 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Rgs2-202ENSMUST00000127206 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm42705-201ENSMUST00000200176 2465 ntTSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Ttc41-202ENSMUST00000075632 4366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Pum2-210ENSMUST00000169089 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Dclre1a-204ENSMUST00000182276 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Htr2a-201ENSMUST00000036653 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Olfr398-203ENSMUST00000214334 5348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Nova1-201ENSMUST00000021438 7154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Emsy-202ENSMUST00000205276 7693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Zfp748-202ENSMUST00000181892 5293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 AC121960.2-201ENSMUST00000227349 3446 ntBASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Clock-205ENSMUST00000202651 9744 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC7.81□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm11912-201ENSMUST00000117235 264 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm15642-201ENSMUST00000148057 311 ntTSL 5 BASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm23327-201ENSMUST00000157420 78 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm26170-201ENSMUST00000158419 148 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm15790-201ENSMUST00000161109 1251 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 4930478M09Rik-201ENSMUST00000201366 1113 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Ttc21bQ0HA38 Gm18127-201ENSMUST00000208479 725 ntBASIC7.8□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 151.7 ms