Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Gm37657-201ENSMUST00000195425 2169 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Zfp90-205ENSMUST00000212874 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Nek10-206ENSMUST00000224491 9567 ntAPPRIS P2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm25213-201ENSMUST00000102388 113 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 4930402F06Rik-201ENSMUST00000113009 1150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm14655-201ENSMUST00000120124 578 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm11731-201ENSMUST00000139704 670 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm4997-201ENSMUST00000154056 360 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm22940-201ENSMUST00000158560 155 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gml-202ENSMUST00000164026 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm6673-201ENSMUST00000166114 700 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm23648-201ENSMUST00000180301 107 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm27684-201ENSMUST00000183778 80 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm38183-201ENSMUST00000193189 205 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Olfr747-202ENSMUST00000205373 1132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm45216-201ENSMUST00000205547 600 ntTSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm45209-201ENSMUST00000207122 353 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm44785-202ENSMUST00000208294 932 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm10043-201ENSMUST00000210691 235 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1266-ps1-201ENSMUST00000214850 180 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 AC166358.7-201ENSMUST00000221132 108 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 AC125543.5-201ENSMUST00000222799 108 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm46389-201ENSMUST00000223199 392 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 AC122858.1-202ENSMUST00000228290 986 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Defb7-201ENSMUST00000047851 306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Olfr513-201ENSMUST00000055146 930 ntAPPRIS P1 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm23515-201ENSMUST00000082829 107 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm23506-201ENSMUST00000083077 107 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 AC124446.1-201ENSMUST00000221027 2644 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Cfb-206ENSMUST00000154526 2397 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Bcas3-204ENSMUST00000108056 2925 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 AC160562.1-201ENSMUST00000216170 3468 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Wdr44-202ENSMUST00000101670 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Akap2-202ENSMUST00000098064 7172 ntTSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 CT030159.2-201ENSMUST00000221233 1742 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Olfr43-204ENSMUST00000215550 1854 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Prickle2-203ENSMUST00000113446 7860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd6-201ENSMUST00000035719 4683 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Ankef1-202ENSMUST00000121717 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm43330-201ENSMUST00000199706 2153 ntBASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Oog1-203ENSMUST00000222332 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 AC126806.1-201ENSMUST00000217349 3869 ntTSL 5 BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Ghitm-202ENSMUST00000165649 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.53□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Wdr72-201ENSMUST00000055879 5196 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Olfr458-202ENSMUST00000216650 1799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm16130-201ENSMUST00000153106 2799 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm44827-201ENSMUST00000207963 2229 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Ctnnd1-203ENSMUST00000067232 6119 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Wdr48-208ENSMUST00000217472 2997 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Olfr1350-202ENSMUST00000207221 1521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Xrcc4-201ENSMUST00000022115 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.88
Lrrc43Q3V0L5 Gm14643-201ENSMUST00000144412 1848 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm17575-201ENSMUST00000180437 1991 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Scrn3-201ENSMUST00000090811 3309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Ypel2-201ENSMUST00000018571 4847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Ighv14-1-201ENSMUST00000103463 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Ighv1-26-201ENSMUST00000103510 351 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Trav6-2-201ENSMUST00000103573 338 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm7421-201ENSMUST00000119298 639 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm11474-201ENSMUST00000120814 277 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm7365-201ENSMUST00000120877 639 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Fam229b-202ENSMUST00000124941 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm13411-201ENSMUST00000149429 414 ntTSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm25339-201ENSMUST00000157458 232 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm25942-201ENSMUST00000180080 110 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Trav6d-5-201ENSMUST00000180687 338 ntAPPRIS P1 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Mug-ps1-203ENSMUST00000190643 655 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm29475-201ENSMUST00000190767 312 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm37189-201ENSMUST00000192131 298 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm37078-201ENSMUST00000193314 2009 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Fcer1g-203ENSMUST00000193973 683 ntTSL 3 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm38079-201ENSMUST00000195603 154 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm42716-201ENSMUST00000196003 680 ntTSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm43718-201ENSMUST00000197524 1857 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm7041-201ENSMUST00000201227 524 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
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Lrrc43Q3V0L5 Olfr686-204ENSMUST00000216613 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 AC155941.1-201ENSMUST00000220223 529 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 AC126554.1-201ENSMUST00000222161 271 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 AC165092.3-201ENSMUST00000223602 282 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Grk3-201ENSMUST00000065167 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Ssxa1-201ENSMUST00000072593 433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Rpgr-203ENSMUST00000073392 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 n-R5s41-201ENSMUST00000083025 119 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm24446-201ENSMUST00000083982 156 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Serpina1e-201ENSMUST00000085054 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm11733-201ENSMUST00000092394 2311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Mbnl3-202ENSMUST00000114875 4649 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Cacna2d4-205ENSMUST00000186622 3710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Ston1-207ENSMUST00000163588 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Cd300lb-201ENSMUST00000106581 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm10248-201ENSMUST00000090409 2731 ntTSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Bcas3-205ENSMUST00000108061 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Tcp10a-201ENSMUST00000095726 2442 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Adgrl2-202ENSMUST00000106128 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm4541-201ENSMUST00000208901 1848 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Gm10623-201ENSMUST00000209081 2639 ntBASIC9.52□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Fblim1-201ENSMUST00000006381 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 AC162467.3-201ENSMUST00000219716 2172 ntBASIC9.51□□□□□ -0.89
Lrrc43Q3V0L5 Luzp4-202ENSMUST00000163338 2025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.51□□□□□ -0.89
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